@article { author = {Pireh, S. and Harighi, B. Harighi}, title = {Phenotypic and genetic properties of Ralstonia solanacearum strains, the causal agent of bacterial wilt of potato isolated from Kurdistan province*}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {1-13}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {Phenotypic properties and genetic diversity of 24 strains of Ralstonia solanacearum causing bacterial wilt of potato plants isolated from various locations in Kurdistan province was investigated. According to physiological and biochemical properties, 19 and 5 of isolates were identified as R. solanacearum biovar 2 and 3, respectively. Identification of isolates was further confirmed by PCR using 759/760 primers specific to R. Solanasearum. Based on multiplex PCR, all strains identified as biovar 2 were belonging to phylotype II. In multiplex PCR, strains identified as biovar 3 produced R. solanacearum species-specific fragment but failed to produce expected phylotype-specific amplicon. Genetic diversity of selected strains was investigated by rep-PCR fingerprinting using REP, ERIC and BOX primers. UPGMA analysis of combined data obtained from rep-PCR fingerprint pattern using Dice,s coefficient revealed the strains could be separated into 5 groups at a similarity level of approximately 43%. There was no direct relationship between geographic locations of strains and grouping. Obtained results demonstrated the existence of a genetic diversity among R. solanacearum strains causing bacterial wilt disease of potato in Kurdistan province.}, keywords = {Bacterial wilt of potato,Genetic diversity,Phylotype,R. solanacearum,rep-PCR}, title_fa = {بررسی خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Ralstonia solanacearum عامل بیماری پژمردگی باکتریائی سیب زمینی جداشده از استان کردستان*}, abstract_fa = {ویژگی های فنوتیپی و تنوع ژنتیکی 24 جدایه باکتری Ralstonia solanacearum عامل بیماری پژمردگی باکتریائی سیب زمینی جدا شده از مناطق مختلف استان کردستان مورد بررسی قرار گرفت. براساس خصوصیات فیزیولوژیک و بیوشیمیائی، 19جدایه R. solanacearum بعنوانبیووار 2 تشخیص داده شدند. پنج جدایه، خصوصیات فنوتیپی بیووار 3 را دارا بودند. صحت تشخیص تمامی جدایه ها در سطح گونه توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز و با استفاده از آغازگرهای 759/760 اختصاصی گونه مورد تایید قرار گرفت. در مطالعه جدایه ها با استفاده از روش (Pmx) Multiplex PCR، تمامی جدایه های تشخیص داده شده تحت عنوان بیووار 2 با تکثیر باندهائی با اندازه تقریبی 282 و 372 جفت باز در فیلوتیپ II قرار گرفتند. پنج جدایه با خصوصیات فنوتیپی شبیه به بیووار3، در واکنش Pmx باند اختصاصی گونه به اندازه تقریبی 282 جفت باز به اضافه باند با اندازه تقریبی 191 جفت باز تکثیر نمودند که اختصاصی هیچکدام از گروه های فیلوتیپی نمی باشد. نوع ژنتیکی جدایه ها به روش rep-PCR و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی REP، ERIC و BOX مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز ترکیبی داده با استفاده از هرسه آغازگر به روش UPGMA و براساس ضریب تشابه دایس نشان داد که جدایه ها در سطح تشابه 43% به 5 گروه قابل تفکیک هستند. ارتباط مشخصی بین گروه بندی بدست آمده و منطقه جغرافیائی جدایه ها مشاهده نشد. نتایج حاصل از این تحقیق نشاندهنده تنوع ژنتیکی در جدایه های R. solanacearumجداسازی شده از استان مورد مطالعه می باشد.}, keywords_fa = {پژمردگی باکتریائی سیب زمینی,تنوع ژنتیکی,فیلوتیپ,R. solanacearum}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27314.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27314_29ce81dd2140ad8e478f693c1c9a8220.pdf} } @article { author = {Saedi, M. and Karegar, A. and Taghavi, S.M.}, title = {Effect of combined application of Pseudomonas fluorescens CHA0 and chemical fertilizers on the activity of root-knot nematode, Meloidogyne incognita, and infected tomato plant in greenhouse*}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {15-30}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {Effects of chemical fertilizers on Meloidogyne incognita activity and Pseudomonas fluorescens CHA0 were studied in vitro. The results showed that the chemical fertilizers increased 67.0-94.8% mortality of the second stage juveniles and decreased 43.8-80.8% egg hatching of the nematode, but did not inhibit the bacterium growth on NA and LB culture + fertilizer. Effect of combined application of P. fluorescens CHA0 and chemical fertilizers, on the activity of M. incognita and growth indices of infected tomato plant cv. Early Urbana was studied in greenhouse in three turns. Results showed that application of triple superphosphate, sulphur, zinc sulphate and copper sulphate in combination with P. fluorescnse CHA0 significantly increased the growth parameters of tomato plants. In the first trial, combination of the bacterium with 50 mg/kg of nitrogen (urea) caused 54.9% and 67.3% reductions in galls and egg masses/gram of root, respectively, and with 10 mg/kg of phosphorus caused 18% reduction in reproduction factor (RF) of the nematode. In the second trial, the bacterium and 5 mg/kg of cupper caused 83.2% and 80.6% reductions in galls and egg masses/gram of root, respectively, and with 100 mg/kg of nitrogen caused 81.7% reduction in RF. In the third trial, the bacterium and 5 mg/kg of cupper caused 74.7% and 81.2% reductions in galls and egg masses/gram of root, respectively, and with 100 mg/kg of nitrogen caused 67.6% reduction in RF. Combination of P. fluorescens CHA0 and copper sulphate was the best treatment in increasing tomato growth parameters and decreasing the nematode indices.}, keywords = {copper sulphate,Management,plant-parasitic nematode}, title_fa = {اثر کاربرد تلفیقی باکتری Pseudomonas fluorescens CHA0 و کودهای شیمیایی بر فعالیّت نماتود ریشه‏گرهی Meloidogyne incognita در گیاه گوجه‏فرنگی آلوده به آن در شرایط گلخانه}, abstract_fa = {تأثیر کودهای شیمیایی بر فعالیّت نماتود ریشه‏گرهی Meloidogyne incognita و جدایه Pseudomonas fluorescens CHA0 در شرایط آزمایشگاه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که کودهای شیمیایی باعث افزایش 0/67-8/94% مرگ‏ومیر لارو سن دو و کاهش 8/43-8/80% تفریخ تخم نماتود نسبت به شاهد شدند ولی مانع رشد باکتری روی محیط کشت NA + کود و LB + کود نشدند. تأثیر کودهای شیمیایی در تلفیق با باکتری بر فعالیّت نماتود و شاخص‏های رشدی گیاه گوجه‏فرنگی رقم ارلی‏اربانا آلوده به آن، در سه آزمون مجزا در خاک سترون در گلخانه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که کودهای سوپرفسفات‏تریپل، گوگرد، سولفات ‏روی و سولفات‏ مس در تلفیق با باکتری باعث افزایش معنی‏دار شاخص‏های رشدی گوجه‏فرنگی در مقایسه با شاهد شدند. در آزمون اول، کاربرد باکتری و 50 میلی‏گرم/کیلوگرم نیتروژن (منبع اوره) باعث کاهش 9/54% و 3/67% تعداد گال و کیسه تخم/گرم ریشه، و تیمار باکتری با 10 میلی‏گرم فسفر باعث کاهش 18% فاکتور تولیدمثل نماتود گردید. در آزمون دوم، تعداد گال و تعداد کیسه تخم/گرم ریشه در تیمار باکتری و پنج میلی‏گرم/کیلوگرم مس به ترتیب، 2/83% و 6/80% کاهش یافت. همچنین تیمار باکتری و نیتروژن 100 میلی‏گرم/کیلوگرم باعث کاهش 7/81% فاکتور تولیدمثل گردید. در آزمون سوم تیمار باکتری و پنج میلی‏گرم/کیلوگرم مس به ترتیب، باعث کاهش 7/74% و 2/81% تعداد گال و تعداد کیسه تخم/گرم ریشه شد. همچنین تیمار باکتری و 100 میلی‏گرم/کیلوگرم نیتروژن باعث کاهش 7/67% فاکتور تولیدمثل گردید. بیشترین افزایش شاخص‏های رشدی گیاه و کاهش شاخص‏های نماتود از کاربرد باکتری و سولفات‏مس حاصل شد.}, keywords_fa = {سولفات مس,نماتود انگل گیاهی,مدیریت}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27315.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27315_3876ec476218b7fe09c9f7e5ef62e0c9.pdf} } @article { author = {Salmaninezhad, F. and Mostowfizadeh-Ghalamfarsa, Reza}, title = {Taxonomy, Phylogeny and Pathogenicity of Pythium Species in Rice Paddy Fields of Fars Province}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {31-53}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {In order to investigate the Pythium species of the rice paddy fields of Fars Province, Iran during 2013 to 2015, infected roots and crowns together with soil around seedlings and irrigation water were sampled. According to the morphological, morphometrical and physiological studies along with phylogenetic analyses based on internal transcribed spacer (ITS) of ribosomal DNA, fourteen Pythium species including Py. aphanidermatum, Py. catenulatum, Py. coloratum, Py. debaryanum, Py. dissotocum, Py. hydnosporum, Py. inflatum, Py. kashmirense, Py. nunn, Py. oopapillum, Py. plurisporium, Py. porphyrae, Py. pyrilobum, and Py. rhizo-oryzae were identified. All species are reported for the first time in the world from rice rhizosphere except Py. dissotocum, Py. inflatum and Py. rhizo-oryzae. Pythium oopapillum, Py. plurisporium, Py. porphyrae and Py. rhizo-oryzae were new to Iran. Pythium aphanidermatum, Py. rhizo-oryzae and Py. catenulatum were the most abundant species. Pathogenicity of Py. debaryanum, Py. oopapillum, Py. porphyrae, Py. plurisporium and Py. rhizo-oryzae on rice plants were reported in this study for the first time, worldwide.}, keywords = {identification,Oomycota,Pythiaceae,Root rot}, title_fa = {تاکسونومی، فیلوژنی و بیماری‌زایی گونه‌های Pythium در شالیزارهای برنج استان فارس}, abstract_fa = {به ­منظور بررسی گونه­های پیتیومی شالیزارهای برنج استان فارس طی سال­های 1392 تا 1394 از خاک، آب آبیاری، ریشه و طوقه­ی گیاهان بیمار نمونه­برداری انجام گرفت. بر اساس نتایج حاصل ازمطالعات ریخت­شناختی، ریخت­سنجی و فیزیولوژیکی جدایه­ها به همراه بررسی­های فیلوژنتیکی فاصله­ی ترانویسی­شده­ی داخلی (آی­تی­اِس) دی­اِن­اِی ریبوزومی با روش پیوست همسایه­ها، 14 گونه­ی Pythium شامل Py. aphanidermatum، Py. catenulatum، Py. coloratum، Py. debaryanum، Py. dissotocum، Py. hydnosporum، Py. inflatum، Py. kashmirense، Py. nunn، Py. oopapillum، Py. plurisporium، Py. porphyrae، Py. pyrilobum و Py. rhizo-oryzae شناسایی شد. تمامی گونه­های یاد شده، به جز گونه­های Py. dissotocum، Py. inflatum و Py. rhizo-oryzae، برای نخستین­بار از فراریشه­ی برنج در دنیا گزارش می­شوند. گونه­های Py. oopapillum، Py. plurisporium، Py. porphyrae، Py. rhizo-oryzae برای ایران جدیدند. فراوان­ترین گونه­های جداشده Py. aphanidermatum، Py. rhizo-oryzae و Py. catenulatum بودند. بیماری­زایی گونه­های Py. debaryanum، Py. oopapillum، Py. plurisporium، Py. porphyrae و Py. rhizo-oryzae روی برنج برای نخستین­بار در دنیا گزارش می­شود.}, keywords_fa = {اُاُمیکوتا,پوسیدگی ریشه,پیتیاسه,شناسایی}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27316.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27316_666ff972f7ee15493220c8822140c9e5.pdf} } @article { author = {Siampour, M. and Izadpanah, Keramatollah}, title = {Serological relationship among three phytoplasma strains belonging to the group 16SrII in Iran}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {51-62}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {Phytoplasmas are among the most important plant pathogens belonging to the class Mollicutes.  In this study the serological relatedness of three 16SrII- related phytoplasmas including lime witches’ broom (LWB; 16SrII-B), alfalfa witches’ broom (AlfWB, 16SrII-C) and cucumber phyllody (CuPh; 16SrII-D) phytoplasmas was examined. A recombinant antibody raised against the Immunodominant membrane protein of the LWB phytoplasma was used in indirect ELISA. Results showed that the produced antiserum reacted with the LWB and AlfWB phytoplasma infected samples, although with lower absorption rate with the later. Under the same conditions, the mean OD obtained from periwinkle extracts infected with CuPh phytoplasma was not significantly different from that of healthy periwinkle. With the antiserum raised against AlfWB phytoplasma, however, the OD value obtained with AlfWB phytoplasma was higher than that obtained with LWB phytoplasma samples. These data suggest that LWB and AlfWB phytoplasmas but not CuPh phytoplasma are serologically related, although not identical. In this study we compared the results of ELISA test and western blot analysis. The serological variation was also compared with Imp and DnaD sequence variability. AS serological distinction is an important criterion for description of new phytoplasma species within a 16S rRNA group, results of this study argues that phytoplasmas of 16SrII-D (CuPh phytoplasma) and II-B (LWB phytoplasma) could be accommodated within two species. However, further evidences are needed to support this argument.  }, keywords = {Phytoplasma,serology,membrane protein,phyllody,witches’ broom}, title_fa = {ارتباط سرولوژیکی میان سه استرین فیتوپلاسمایی از گروه 16SrII در ایران}, abstract_fa = {فیتوپلاسماها شامل گروهی از بیمارگرهای مهم گیاهی از رده مولیکوتها هستند. در این مطالعه ارتباط سرولوژیکی سه فیتوپلاسما از گروه 16SrII شامل فیتوپلاسماهای جاروک لیموترش( زیر گروه 16srII-B)، جاروک یونجه (زیر گروه 16SrII-C) و فیلودی خیار (زیرگروه 16SrII-D) مورد بررسی قرار گرفت. در این ارتباط از آنتی سرم نوترکیب تولید شده بر علیه پروتئین غشاء فیتوپلاسمای جاروک لیموترش در الیزای غیر مستقیم استفاده شد . آنتی سرم مذکور قادر به شناسایی نمونه های پروانش آلوده به فیتوپلاسمای جاروک لیموترش و فیتوپلاسمای جاروک یونجه (با میانگین جذب نوری کمتر) بود لکن بین میانگین جذب نوری عصاره گیاه آلوده به فیتوپلاسمای فیلودی خیار و گیاه سالم تفاوت معنی داری مشاهده نشد. هنگامی که در آزمون الیزا از آنتی سرم فیتوپلاسمای جاروک یونجه استفاده شد، میانگین جذب عصاره گیاه مبتلا به فیتوپلاسمای خودی بیشتر از میانگین جذب عصاره آلوده به فیتوپلاسمای جاروک لیمو ترش بود. با توجه به این نتایج، دو فیتو پلاسمای جاروک لیموترش و جاروک یونجه با یکدیگر ارتباط سرولوژیکی داشتند هر چند مقادیر جذب نوری در آزمون الیزا بین این دو فیتوپلاسما از نظر آماری متفاوت بود. در این مطالعه نتایج بدست آمده در آزمون الیزا با نتایج آزمون لکه برداری وسترن مقایسه شد و ارتباط آن با تنوع ژنتیکی ژن Imp مورد بحث قرار گرفته است.با توجه به اهمیت تعیین ارتباط سرولوژیکی بین فیتوپلاسماها برای شناسایی گونه های جدید، احتمال می رود که فیتوپلاسماهای زیرگروه 16SrII-B (جاروک لیموترش) و فیتوپلاسماهای زیرگروه 16SrII-D متعلق به گونه های متفاوتی باشند. با این وجود برای اثبات این فرضیه به شواهد بیشتری نیاز است}, keywords_fa = {فیتوپلاسما,سرولوژی,پروتئین غشاء,فیلودی,جاروک}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27317.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27317_2a4aa074e2660d96934635b1e6f60de4.pdf} } @article { author = {Tahmasebi, A. and Afsharifar, A. and Rabiee, S. and Izadpanah, K.}, title = {Altered expression of autophagy-related genes in Nicotiana benthamiana plants in response to Potato virus A HC-Pro silencing suppressor}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {63-74}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {Accumulating data have revealed the role of autophagy in virus-induced RNA silencing via viral RNA silencing suppressor activity. To extend our understanding for the possible role of Potato virus A-HC-Pro (PVA-HC-Pro) suppressor protein in autophagy process, we investigated the effect of PVA-HC-Pro on expression of some important genes involved in autophagy. The cDNA of ORF PVA HC-Pro was cloned in pGWB17 vector with a C-terminal myc tag and N-terminal 35S promoter using Gateway technology. Agrobacterium cultures harboring PVA-HC-Pro were infiltrated into the abaxial side of N. benthamiana leaves. The expression of ATG6, ATG2, ATG7 and AGO1 genes were measured at 5 days post infiltration in response to PVA-HC-Pro using qRT-PCR technique. PVA HC-Pro as a suppressor of RNA silencing increased the expression level of ATG6, ATG2 and ATG7 5.89, 7.3 and 7.6 fold, respectively, compared to corresponding values in leaves infiltrated with empty plasmid (EP) as a control. In contrast, the transcript level of Argonaute1 (AGO1), a key component of RNA-induced silencing complex (RISC), was decreased by 1.36-fold compared to the level of AGO1in infiltrated leaves without PVA-HC-Pro. Results of this study indicated that PVA HC-Pro can alter the expression of autophagy related genes in N. benthamiana plant. These findings suggest the involvement of ATG6, ATG2, ATG7 and AGO1 in defense responses of N. benthamiana against PVA-HC-Pro, which might be considered in plant breeding programs as a novel approach to the control of plant viruses.}, keywords = {: Autophagy,HC-Pro,N. benthamiana,RNA silencing,Suppressor of RNA Silencing}, title_fa = {تغییر بیان ژن‌های مرتبط با اتوفاژی در پاسخ به سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب‌ زمینی (Potato virus A) در گیاه Nicotiana benthamiana}, abstract_fa = {در سال­های اخیر نقش اتوفاژی در خاموشی آر­ان­ای القاء شده توسط ویروس از طریق فعالیت پروتئین­های سرکوبگر خاموشی آر­ان­ای به اثبات رسیده است. به منظور درک بهتر نقش احتمالی سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب ­­زمینی در فرآیند اتوفاژی (autophagy)، اثر این سرکوبگر ویروسی روی بیان تعدادی از ژن­های مهم و دخیل در اتوفاژی مورد بررسی قرار گرفت. ژنHC-Pro  ویروس ای سیب ­­زمینی در ناقل بیان pGWB17 با برچسبmyc  در انتهای کربوکسیلی و پروموتور 35S در انتهای آمینی توسط تکنولوژی  gatewayهمسانه­سازی شد. کشت­های اگروباکتریوم حاوی  HC-Proویروس ای سیب ­زمینی با استفاده از سرنگ در ناحیه پشتی برگ­های گیاه Nicotiana benthamianaتزریق شدند. بیان ژن­های ATG2، ATG7،  ATG6و AGO1در پاسخ به سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب ­زمینی، در فاصله زمانی پنج روز پس از تزریق، با استفاده از تکنیک ریل تایم پی­سی­آر (Real-Time PCR) اندازه­گیری شدند. سرکوبگر خاموشیHC-Pro   ویروس ای سیب ­زمینی میزان بیان ژن­های ATG6، ATG2و ATG7را به میزان ۸۹/۵، ۳/۷ و ۶/۷ برابر نسبت به برگ­های تزریق شده با سازه حاوی پلاسمید خالی pGWB افزایش داد. در حالی­که میزان رونوشت  AGO1به­عنوان جزء کلیدی کمپلکس خاموشی القاء شده توسط آر­ان­ای، به میزان ۳۶/۱ برابر نسبت به میزان آن در برگ­های فاقد  HC-Proکاهش نشان داد. نتایج این تحقیق حاکی از دخالت ژن­های ATG2، ATG7، ATG6و AGO1در پاسخ­های دفاعی گیاه  N .benthamianaدر مقابل سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب­ زمینی و امکان استفاده از آن در تدوین روش­های جدید مدیریت ویروس­های گیاهی می­باشد.}, keywords_fa = {اتوفاژی,سرکوبگر خاموشی,HC-Pro,Nicotiana benthamiana,خاموش سازی آر‌ان‌ای}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27318.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27318_30df56c065edf152acfbed79aa51b213.pdf} } @article { author = {Salehi, M. and Bagheri, A. and Faghihi, M. M. and Izadpanah, K.}, title = {Study of partial biological and behavioral traits of Hishimonus phycitis, vector of lime witches’ broom, for management of the disease}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {75-96}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {Witches’ broom disease of lime (WBDL) is a serious threat to lime industry in Iranian southern provinces. Vector identification and transmission characteristics are main factors in epidemiology and management of phytoplasma diseases including WBDL. Investigation of the collected sucking insect fauna on witches’ broom infected lime trees in Hashtbandee, Minab and Roodan (Hormozgan province) using PCR and RFLP assays showed that Hishimonus phycitis leafhopper and Diaphorina citri were positive for 'Ca. Phytoplasma aurantifolia' presence. However, only H. phycitis, previously identified as vector of WBDL, successfully transmitted the phytoplasma to Bakraee (Citrus reticulate hybrid) seedlings and bearing lime trees. Host range studies showed that H. phycitis can reproduce only on citrus and ziziphus species and was unable to reproduce on eggplant, watermelon, alfalfa and carrot, reported hosts of H. phycitis in india. Results of population fluctuation revealed a main peak for the H. phycitis from February to March. However, the lowest population density was observed in warm months (May to October). The population density of vector on healthy and witches’ broom affected trees was compared and the results revealed that the population density of vector was significantly higher on witches’ broom affected trees than healthy ones. It can demonstrate that in affected lime trees, witches’ broom branches can prepare appropriate niche for H. phycitis reproduction. On the basis of the above data, it is possible to predict that cutting of witches’ broom can be an effective approach for reduction of vector population and WBDL management.}, keywords = {Candidatus Phytoplasma aurantifolia,Hishimonus phycitis,leafhopper vector,lime,molecular analyses}, title_fa = {تعیین برخی ویژگی‌های زیستی و رفتاری زنجرک Hishimonus phycitis، ناقل بیماری جاروک لیموترش با هدف مدیریت بیماری}, abstract_fa = {تعیین ناقل و ویژگی­های انتقال یکی از فاکتورهای کلیدی در مطالعه اپیدمیولوژی و کنترل بیماری­های فیتوپلاسمایی از جمله بیماری فیتوپلاسمایی جاروک لیموترش می­باشد. تحقیق حاضر با هدف شناسایی ناقل/ناقلین بیماری جاروک لیموترش و بررسی برخی ویژگی­های ناقل این بیماری طی سال­های 90-1385 در استان­های هرمزگان و فارس انجام شد. بررسی­های به عمل آمده در مورد حشرات مکنده جمع آوری شده در باغ­های آلوده هشتبندی، میناب و رودان (استان هرمزگان) با استفاده از آزمون پی­سی­آر و RFLP نشان داد که فیتوپلاسمای مزبور تنها در بدن زنجرک Hishimonus phycitis و پسیل آسیایی مرکبات (Diaphorina citri) وجود دارد ولی تنها زنجرکH. Phycitis  که پیشتر به عنوان ناقل معرفی شده قادر به انتقال فیتوپلاسما می­باشد. زنجرک H. Phycitis  در شرایط طبیعی فقط از روی لیموترش و بکرایی جمع آوری شد در صورتی­که در شرایط گلخانه، این زنجرک زیر سرپوش پلاستیکی روی کنار و گونه­های مختلف مرکبات تکثیرشد. زنجرک ناقل روی گیاهان علفی شامل بادنجان، هندوانه، هویج ویونجه که در هند به عنوان میزبان این زنجرک گزارش شده­اند، تکثیر نشد. جمعیت زنجرک ناقل در ماه­های بسیار گرم (خرداد تا آبان) روی درختان لیموترش بسیار پایین بود ولی با خنک شدن هوا، جمعیت آن به تدریج افزایش یافت به طوری­که در اواخر زمستان و بهار به بیشترین تعداد رسید. جمعیت حشره ناقل روی درختان آلوده لیموترش با اختلاف بسیار معنی­داری بیشتر از جمعیت آن روی درختان سالم بود که می­تواند نشان دهنده اثرگذاری جاروک­ها در جلب و تکثیر حشره ناقل و امکان کنترل حشره ناقل و متعاقب آن بیماری جاروک از طریق حذف جاروک­ها باشد.}, keywords_fa = {آنالیز مولکولی,'Candidatus Phytoplasma aurantifolia',Hishimonus phycitis,زنجرک ناقل,لیموترش}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27319.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27319_1a924af6173c4a43517200ad8a99eea6.pdf} } @article { author = {Zolanvari, S. M. and Mostowfizadeh-Ghalamfarsa, R. and Dadkhodaie, A.}, title = {Molecular Identification and Detection of Phytophthora melonis Based on Nuclear and Cytoplasmic Genome}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {97-117}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {The plant pathogen Phytophthora melonis is morphologically similar to some other non-papillate Phytophthora spp. especially P. drechsleri and therefore it is difficult to discriminate these convergent taxa. This study was performed to design specific primers based on nuclear and cytoplasmic genome, examine their specificity against other convergent species, and optimize the specific primers’ conditions to detect P. melonis. Nine nuclear and four cytoplasmic genes were appropriate to design thirteen specific primers based on their nucleotide polymorphism. PCR conditions were optimized. Phytophthora melonis were detected by specific primers in inoculated plants such as cucumber, watermelon, melon, sugar beet and pistachio. All specific primers detected pathogen in 1:100 (pathogen: soil) inoculated soil.Up to 10 zoospores per milliliter were detected using nested polymerase chain reaction. ITS-MF1 and ITS-MR2 (ITS-M2 set, from internal transcribed spacers of rRNA gene) were selected as the most efficient primers based on their specificity and sensitivity. The optimized annealing temperature for this primer set was 68 °C. It seemed that nested PCR by ITS-M2 primer set together withthe universal primers ITS6 and ITS4 as external primers is at least 106 times more sensitive than simple PCR. Multiplex polymerase chain reaction simultaneously detected the three cucurbits’ pathogens including P. melonis, P. nicotianae and P. drechsleri. This study showed that the designed primers could be effective tools for detection of P. melonis isolates from infected tissues, and infested water and soil.}, keywords = {Detection,identification,Oomycota,Root rot,specific primers}, title_fa = {شناسایی و ردیابی مولکولی Phytophthora melonis بر‌اساس ژنوم هسته‌ای و میتوکندریایی*}, abstract_fa = {گونه­ی بیمارگر گیاهی Phytophthora melonis از نظر ریخت­شناختی به برخی گونه­های بدون پستانک جنس Phytophthora به­خصوص P. drechsleri شباهت دارد وبنابراین تفکیک این آرایه­های هم­گرا دشوار است. این پژوهش به منظور طراحی آغازگرهای اختصاصی P. melonis بر اساس ژنوم هسته­ای و میتوکندریایی، بررسی اختصاصیت آن­ها در برابر سایر گونه­های همگرا، و بهینه­سازی استفاده از این آغازگرها برای ردیابی P. melonis انجام شد. برای طراحی آغازگر­های اختصاصی گونه­ی P. melonis نُه ژن­ هسته­ای و چهار ژن میتوکندریایی از نظر تفاوت نوکلئوتیدی مناسب بودند، بنابراین سیزده آغازگر اختصاصی طراحی و خصوصیات آن­ها بهینه‌سازی گردید. ردیابی P. melonis با استفاده از پنج جفت از آغازگر­های اختصاصی در بافت مایه­زنی شده­ی گیاهان میزبان آن شامل خیار، خربزه، هندوانه، چغندر­قند و پسته­ انجام شد. با استفاده از آغازگرهای طراحی شده در واکنش زنجیره‌ای پلیمراز تودرتو، تا سطح یک درصد مایه­ی بیماری­زا­ در خاک آلوده و زئوسپورهای بیمارگر تا غلظت­10 زئوسپور در میلی­لیتر در آب آلوده ردیابی شدند. با بررسی اختصاصیت و حساسیت آغازگر­های طراحی شده، کارامد­ترین آن­­­ها مجموعه­ی ITS-M2 (ترکیب آغازگرهای ITS-MF1 و ITS-MR2) در نظر گرفته شد. دمای هم­جوشی بهینه‌سازی شده برای این مجموعه 68 درجه­ی سلسیوس بود. به نظر می‌رسد استفاده از واکنش زنجیره­ای پلیمراز تودرتو با استفاده از مجموعه­ی ITS-M2 به همراه آغازگر­های عمومی ITS4 و ITS6 در نقش آغازگر­های خارجی در حدود 106 برابر حساس­تر از واکنش زنجیره­ای پلیمراز مستقیم است. ­آزمون زنجیره­ای پلیمراز چندگانه‌ی طراحی شده، قادر به ردیابی هم­زمان سه گونه­ی بیمارگر شامل P. melonis، P. drechsleri و P. nicotianae بود.آزمایش‌ها نشان داد که آغازگر­های طراحی شده ابزاری کارآمدی برای ردیابی P. melonis در بافت گیاه، خاک و آب آلوده هستند.}, keywords_fa = {اُاُمیکوتا,آغازگر اختصاصی,پوسیدگی ریشه,ردیابی,شناسایی}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27320.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27320_365f032c2347fad3fc89f538a7d734fe.pdf} } @article { author = {Safavi, S.A. and Afshari, F.}, title = {First report of virulence to resistance gene Sr25 by the stem rust pathogen (Puccinia graminis f. sp. tritici) in Ardabil, North West of Iran}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {119-122}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {    Stem (black) rust, caused by Puccinia graminis Pers. f. sp. tritici Erikss. & Henning, is one of the most destructive diseases of wheat around the world. It could be controlled through deployment of race-specific resistance genes (Jain et al. 2009). However, such kind of resistance is mostly short lived due to emergence of new virulences. For example, due to emergence of Ug99 resistance genes Sr5,Sr6, Sr7a, Sr7b, Sr8a, Sr8b, Sr9a, Sr9b, Sr9d, Sr9e, Sr9f, Sr9g, Sr9h, Sr10, Sr11, Sr12, Sr16, Sr17, Sr18, Sr19, Sr20, Sr21, Sr23, Sr24, Sr30, Sr31, Sr34, Sr36, Sr38, Sr41, Sr49, Sr54, SrMcN, SrWld-1 are no longer effective (Singh et al. 2015) and cannot be used in breeding programs. Monitoring of new virulence factors has remained very important in the evaluation and identification of new sources of resistance. Considering to the importance of stem rust especially the race of Ug99 (also named TTKSK), during cropping season of 2015-2016, virulence of the wheat stem rust was investigated by planting 47 isogenic lines (in national trap nursery) under field conditions. This survey was conducted in Ardabi Agricultural Research Station (38.17°N, 48.39°E, 1350 m Height), North West of Iran. Each entry was planted in two 1 meter rows which were spaced 30cm apart. Plots were spaced at 65 cm. A susceptible spreader (Morocco) row was sown around the borders of the experiment and 10 entry intervals.All the required cultural practices were carried out during the experiment. Disease severity was estimated according to the modified Cobb,s scale; 0% = immune, and 100% = fully susceptible when disease was well-developed (Peterson et al. 1948). The infection type (IT) of disease was also recorded based on Roelfs et al. (1992). The presence of virulence factors was determined by susceptible infection type while monitoring the disease on differential sets. In other words, corresponding genes against virulence factors of pathogen in plants were considered as ineffective genes and corresponding genes against avirulence factors of pathogen were considered as effective resistance genes. Results showed that there is virulence to resistance gene Sr25, a gene from Thinopyrum elongatum, which is located on chromosome 7DL and linked with leaf rust resistance gene Lr19. The resistance Sr25 had been effective or partially effective against stem rust worldwide, including race Ug99 (Singh et al. 2011). The detection of Sr25 virulence is significant since Sr25 is an important gene to be targeted for breeding wheat cultivars resistant to Ug99. In this research, ineffectiveness of Sr25 was observed in first time in Ardabil (Northwest of Iran), and thus we should not use this resistance gene in breeding program (at least in Ardabil). Before of this report, viulence to Sr25 had also been reported in India (Jain et al. 2009). Considering to rapid spread of Ug99 and its threat in some parts of Iran (Nazari et al. 2009), and in order to obtain of durable resistance, adult plant resistance (APR) or slow rusting genes such as Sr2, Sr55, Sr56, Sr57 and Sr58 should be deployed in combination with each other or with effective seedling (all-stage) resistance genes; Sr22, Sr26, Sr33, Sr35, Sr45 and Sr50.}, keywords = {Wheat,Stem rust,Ug99,Sr25}, title_fa = {اولین گزارش از بیماری‌زائی زنگ ساقه گندم (Puccinia graminis f. sp. tritici) بر روی ژن Sr25 در اردبیل٬ شمالغرب ایران}, abstract_fa = {    زنگ ساقه یا سیاه گندم، با عامل Puccinia graminis Pers. f. sp. tritici Erikss. & Henning، یکی از مخرب­ترین بیماری­های گندم در سراسر جهان به شمار می­رود. این بیماری با به بکارگیری ژن­های مقاومت اختصاص- نژادی کنترل می­شد، اما این نوع مقاومت پایدار نبوده و با ظهور نژادهای جدید عامل بیماری کارائی خود را از دست می­داد (Jain et al. 2009). به عنوان مثال، با ظهور نژادUg99  ژن­های مقاومت Sr5 ٬Sr6٬Sr7a ٬Sr8a ٬Sr8b٬Sr9a ٬Sr9b ٬Sr9f٬Sr9h ٬Sr10٬Sr16٬Sr18 ٬Sr19٬Sr20 ٬Sr23 ٬Sr24٬Sr30 ٬Sr31 ٬Sr34٬Sr36٬Sr38 ٬Sr41٬Sr49٬Sr54 ٬SrMcN٬SrWld-1 ٬Sr9d ٬Sr9e٬Sr9g ٬Sr11٬Sr12٬Sr17  و S21 دیگر موثر نبوده و نمی­توان از آنها در برنامه­های به نژادی استفاده کرد (Singh et al. 2015). ردیابی فاکتورهای بیماریزائی جدید در ارزیابی و تشخیص منابع جدید مقاومت بسیار مهم و حیاتی هستند.  با توجه به اهمیت بیماری زنگ ساقه و به ویژه نژاد Ug99، در فصل زراعی 95-1394 برای تعیین کارائی ژن­های مقاومت به زنگ ساقه پروژه­ای با کاشت لاین­های ایزوژنیک در خزانه تله تحت شرایط مزرعه­ای اجرا و مطالعه شد. این بررسی در ایستگاه تحقیقات کشاورزی اردبیل (با مشخصات جغرافیایی: عرض شمالی 38 درجه و 17 دقیقه، طول شرقی 48 درجه و 39 دقیقه، ارتفاع از سطح دریا 1350 متر) انجام شد. هر ژنوتیپ در ردیف های یک متری با دو خط به فاصله 30 سانتی متر کاشته شدند فاصله پشته ها نیز 65 سانتی متر در نظر گرفته شد رقم حساس (موروکو) در اطراف خزانه وحد فاصل ارقام به فاصله هر ده رقم کاشته شد. تمام عملیات زراعی مورد نیاز در طی سال اجرای پژوهش انجام شدند. شدت بیماری بر اساس روش اصلاح شده کب از صفر تا 100 درصد انجام شد (Peterson et al. 1948). زمانی که بیماری روی برگ پرچم پیشرفت کرد تیپ آلودگی (IT) براساس روش رولفز و همکاران (Roelfs et al. 1992) یادداشت برداری شد. وجود فاکتورهای بیماریزایی با مقایسه تیپ آلودگی رقم حساس ضمن پایش بیماری روی ارقام افتراقی تعیین شد. به عبارت دیگر ژن­هایی مقابل فاکتورهای بیماریزایی بیمارگر در گیاهان به عنوان ژن­های غیر موثر در نظر گرفته شدند که   شکل 1 – علائم زنگ ساقه گندم  روی لاین گندم LC SR25 ARS (حاوی ژن مقاومت Sr25) در ایستگاه اردبیل – سال 1395 Figure 1. Symptoms of stem rust on wheat line LC SR25 ARS (having resistance gene Sr25) in Ardabil, 2016   بیماریزایی روی آنها وجود داشت و تیپ آلودگی MSS یا S بود و ژن­های مسئول مقاومت در گیاه در برابر فاکتورهای غیر بیماریزایی (Avr-genes) به عنوان ژن­های مقاومت موثر در نظر گرفته شدند. نتایج این بررسی بیانگر وجود بیماریزائی در جمعیت نژادی مستقر در اردبیل روی ژن Sr25 (لاین LC SR25 ARS) بود. این ژن با ژن مقاومت Lr19 (ژن مقاوم به زنگ قهوه­ای) روی کروموزوم 7DL با یکدیگر پیوستگی داشته و از Thinopyrum elongatum به گندم منتقل شده است (Singh et al. 2011). این ژن نسبت به زنگ سیاه گندم (و نژاد Ug99) در سراسر جهان موثر یا نسبتاً موثر بوده است (Singh et al. 2011). ظهور بیماریزائی روی ژن Sr25 مهم است، زیرا این ژن به دلیل مقاومت در برابر گروه نژادی Ug99 در برنامه­های به نژادی مورد هدف بود. در این بررسی عدم کارائی Sr25 در برابر نژادهای محلی زنگ ساقه نشان داده شد و در ایران برای اولین بار از اردبیل گزارش می­شود. بیماریزائی برای ژن یادشده قبلاً از هندوستان نیز گزارش شده بود. با توجه به عدم کارائی این ژن بایستی در برنامه های به نژادی از بکار گیری آن (حداقل در اردبیل) خودداری گردد. برای رسیدن به مقاومت پایدار و با درنظر گرفتن خطر شیوع نژاد Ug99  در قسمت های مختلف ایران (Nazari et al. 2009) بایستی ژن­های مقاومت گیاه کامل مانندSr2 ٬ Sr55٬Sr56 ٬Sr57 ٬ Sr58 در ترکیب با یکدیگر و یا با ژن­های مقاومت گیاهچه­ای (اختصاص-نژادی) موثر مانند Sr22٬Sr26 ٬Sr33 ٬ Sr35٬Sr45٬ وSr50   بکار گرفته شوند}, keywords_fa = {گندم,زنگ ساقه,Ug99,Sr25}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27321.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27321_c6a67b46a9e4c0f9897ddc226745acaf.pdf} } @article { author = {Asgari, M. and Eskandari, Ali}, title = {First record of Ogma floridensis (Nematoda: Criconematidae) from Iran}, journal = {Iranian Journal of Plant Pathology}, volume = {53}, number = {1}, pages = {123-127}, year = {2017}, publisher = {}, issn = {0006-2774}, eissn = {2783-5189}, doi = {}, abstract = {    The genus Ogma Southern 1914 belongs to the family Criconematidae Taylor, 1936, that can be differentiated from other genera of the family by its offset head annuli, vulva closed and presence of 6-26 longitudinal rows of appendages of various shape on cuticular annuli of both females and juveniles. In ongoing faunistic studies on plant parasitic nematodes of Zanjan province, one known Ogma species was recovered from rhizosphere of poplar tree in Shilandar village, Zanjan province and was identified as Ogma floridensis Vovlas, Inserra & Esser, 1991. This species is reported from Iran for the first time and described here.}, keywords = {}, title_fa = {اولین گزارش از نماتود Ogma floridensis (Nematoda: Criconematidae) در ایران}, abstract_fa = {جنس Ogma Southern, 1914 متعلق به خانواده Criconematidae Taylor, 1936 است که به دلیل تمایز حلقه­های سر نسبت به سایر حلقه­های بدن، شکاف تناسلی بسته و وجود 6-26 ردیف از تزئینات خار یا فلس مانند در سطح کوتیکول بدن افراد ماده و جوان، از سایر جنس­های این خانواده متمایز می­گردد. تاکنون دو گونه متعلق به این جنس، شامل O. murrayi Southern, 1914 توسط اشرفی و همکاران (Ashrafi et al. 2012) و O. fagini Escuer & Bello, 1996 توسط نیاستی و همکاران (Niasti et al. 2016) از ایران گزارش شده است. در مطالعات فونستیک مرتبط با شناسایی نماتودهای انگل گیاهی استان زنجان، گونه­ی دیگری از این جنس با نام O. floridensis Vovlas, Inserra & Esser, 1991 از خاک اطراف ریشه صنوبر در روستای شیلاندر، جداسازی و شناسایی گردید که برای فون نماتودهای ایران جدید است. مشخصات این گونه شامل: ماده­ها. سر دارای دو حلقه متمایز از سایر حلقه­های بدن، حلقه اول سر متمایل به جلو، دارای حاشیه نامنظم، به عرض 17(15-19) و حلقه دوم آن متمایل به جلو یا طرفین بدن، دارای حاشیه صاف، به عرض 15 (14-17) میکرومتر؛ سر از دید روبرو دارای چهار برجستگی مجاور میانی (submedian lobes)؛ عرض حلقه اول بدن 23 (21-25) و عرض حلقه دوم آن 28 (25-30) میکرومتر؛ استایلت بلند و باریک و در بعضی نمونه­ها خمیده، دارای گره­های لنگر مانند (anchor-shape)، متوسط طول حلقه­های بدن 7/7 میکرومتر، حلقه­های بدن متمایل به سمت عقب و دارای 10 تا 11 ردیف از فلس­های زبانی شکل ساده یا دو قسمتی و به ندرت سه قسمتی؛ لوله تناسلی مستقیم، حاوی اسپرم، شکاف تناسلی بسته. دم نسبتاً بلند و مخروطی، دو یا سه حلقه آخر دم بدون تزئینات یا دارای حاشیه نامنظم و حلقه آخر آن ساده و یک قسمتی است (شکل 1). نرها. دارای ناحیه لبی گرد به عرض 11-13 و ارتفاع 5-7 میکرومتر؛ فاقد استایلت و مری؛ متوسط طول حلقه­های بدن چهار میکرومتر، بورسا کوچک، هیپوپتیگما مشخص، اسپیکول به طول 38-41 میکرومتر و خمیده، گوبرناکولوم اندکی خمیده به طول 7-8 میکرومتر است (شکل 1).}, keywords_fa = {-}, url = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27322.html}, eprint = {https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27322_03ce0bcae9ee7e3eeb25bd511cd603bf.pdf} }