ORIGINAL_ARTICLE
تأثیر GR24، یک ترکیب مصنوعی مشابه با استریگولاکتونها، بر فعالیتهای فیزیولوژیکی و ریختشناختی Ustilago maydis
Ustilago maydisاز شاخه بازیدیومیکوتها و عامل بیماری مخرب سیاهک عمومی ذرت و سورگوم میباشد. اینگونه در طول چرخه زندگی خود دارای مراحل مختلف هاپلوئید، دیکاریوتیک و دیپلوئید است. در اثر تلاقی بین دو سلول هاپلوئید سازگار روی سطح برگ مرحله دیکاریوتیک ایجاد میشود که قادر به بیماریزایی در گیاه میباشد. اگر چهU. maydis از طریق اندامهای هوایی و ریشه قادر به نفوذ است ولی علایم بیماری تنها روی اندامهای هوایی ظاهر میشود. با توجه به اینکه ترشحات ریشه نقش بسیار مهمی در تعاملات بین گیاه و سایر میکروارگانیسمها دارد در این مطالعه نقش GR24 (یک ماده شیمیایی مشابه با استریگولاکتونها) در تحریک فعالیتهای فیزیولوژیک و ریختشناسی U. maydisبررسی شد. با استفاده از روشهای مختلف اندازهگیری تنفس سلولی میزان تغییرات تنفس سلولی بعد از تحریک سویههای مختلف U. maydis با GR24 اندازهگیری شد. مشاهدات ما نشان داد که یک ساعت بعد از تحریک، میزان تنفس سلولی 11 درصد افزایش یافت اما بعد از سه و پنج ساعت تحریک، میزان تنفس سلولی بهترتیب به میزان هشت و پنج درصد کاهش یافت که این کاهش میتواند بهعلت آثار سمزدایی قارچ در برخورد با مولکول خارجی باشد. میزان بیان تعدادی از ژنهای دخیل در بیوتروفی و تنفس سلولی با استفاده از روش Real-time PCR مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج نشان میدهد که بیان ژنهای تنفس سلولی در سلولهای تحریک شده با GR24 نسبت به شاهد افزایش یافت. با این حال GR24 تأثیری در تغییر شکل ظاهری و تبدیل حالت مخمری به فاز میسلیومی سویه هاپلوئیدU. maydis نداشت. این مولکول با افزایش تنفس سلولی میتواند در نفوذپذیری قارچ به ریشه و واکنشهای دفاعی گیاه مؤثر باشد ولی نقشی در بیماریزایی قارچ ایفا نمیکند.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15644_b10207a5b600328b5600872378087317.pdf
2012-12-01
291
302
تغییرات فیزیولوژیکی
تنفس سلولی
ژنهای بیوتروف
GR24
Ustilago maydis
سید کاظم
صباغ
1
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
بررسی بیماری شانکر درختان میوه هستهدار و اثر ضد باکتریایی برخی اسانسهای گیاهی بر باکتری عامل آن در استان کرمان
علایم بیماری شانکر باکتریایی درختان میوه هستهدار در مناطقی از استان کرمان بهصورت پراکنده مشاهده شد. از نمونههای مشکوک، باکتری سودوموناس روی محیط آگار غذایی حاوی ساکاروز جدا گردید. تعدادی از جدایهها در توتون فوقحساسیت ایجاد کردند، کاتالاز مثبت بوده، در محیط 5 درصد نمک طعام رشد کردند و توانائی تولید رنگدانه سبز فلورسنت، هیدرولیز ژلاتین، کازئین، آربوتین و توئین 80 را داشتند. واکنش اکسیداز، اورهآز و آرژنین دهیدرولاز منفی و هیدرولیز نشاسته، لستیناز، احیا نیترات، توانائی در لهانیدن ورقههای سیبزمینی و رشد در°C37 در آنها دیده نشد. این جدایهها ازگالاکتوز، مانوز، مانیتول، سوربیتول و آرابینوز اسید تولید کرده، ولی هیچکدام از لاکتوز، مالتوز و دی- تارتارات استفاده نکردند. جدایههای اکسیداز منفی با تولید زهرابه از رشد قارچ Geotrichum candidum ممانعت نمودند و قطعه 720 جفت بازی از ژن syrB در آنها تکثیر شد. نقوش الکتروفورزی پروتئینهای سلولی این جدایهها شبیه به پاتووار مرجعPseudomonas syringae pv. syringae (IBSBF451) بود و بیماریزایی آنها با تزریق سوسپانسیونی حاوی 106 سلول در هر میلیلیتر به سرشاخههای هلو، به اثبات رسید. براساس نتایج آزمونهای فنوتیپی و تعیین توالی ناحیه ITS، باکتریهای مذکور Pseudomonas syringae pv. syringae تشخیص داده شدند. برای بررسی اثر ضدباکتریایی، اسانس تعدادی از گیاهان استخراج و در شرایط آزمایشگاهی بر جدایهها آزموده و نتایج آن با اثر 13 ترکیب آنتیبیوتیکی مورد مقایسه قرار گرفت. بررسیها نشان داد که از میان آنتیبیوتیکها، تتراسایکلین، اکسیتتراسایکلین و داکسیسایکلین از رشد کلیه جدایهها ممانعت به عمل آوردند، اما در برابر آمپیسیلین، سفالکسین و اگزاسیلین، حساسیت مشاهده شد. آزمون مذکور نشان داد که برخی از اسانسها دارای خاصیت ضد باکتریائی هستند و در میان آنها اسانس آنغوزه و رزماری، دارای بیشترین تأثیر بوده و با اثرات اکسیتتراسایکلین و داکسیسایکلین برابری میکنند.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15645_da09427be189147b69bcefc571ef66cf.pdf
2012-12-01
303
317
سودوموناس سیرینگی
شانکر باکتریایی هستهداران
شناسایی
اسانس گیاهی
کرمان
پژمان
خدایگان
pezhman_khodaygan@yahoo.com
1
مسئول مکاتبه
AUTHOR
ابراهیم
صداقتی
sedaghatiebrahim@yahoo.com
2
نویسنده
AUTHOR
اکبر
حسینیپور
3
نویسنده
AUTHOR
ساره
بقایی راوری
4
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
کمک به شناسایی گونههای Pseudocercospora در ایران
به منظور شناسایی گونههای جنس Pseudocercospora نمونهبرداری از مناطق مختلف استانهای شمالی کشور در طول تابستان و پاییز سال 1389 انجام شد. علاوه بر این نمونههای موجود در مجموعه قارچهای وزارت جهاد کشاورزی واقع در مؤسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور نیز مورد بازبینی قرار گرفتند. گونههای Pseudocercospora atromarginalis (روی Solanum nigrum)، P. cruenta (روی Vigna sinensis)، P. griseola (روی Phaseolus vulgaris)، P. heteromalla (روی Rubus sp.)، P. kaki (روی Diospyros lotus D. kaki)، P. punicae (روی Punica granatum)، P. salicina (روی Salix alba) و P. vitis (روی Vitis sylvestris) شناسایی شدند. از بین این گونهها، P. heteromalla وP. salicina برای اولینبار از ایران گزارش میشوند. همچنین نام Phaeoisariopsis griseola به Pseudocercospora griseola تغییر یافت. نام سایر گونهها در فهرست قارچهای ایران آمده است.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15646_5bf2e22ff675118a1d2d13acfca25c6c.pdf
2012-12-01
319
327
Pseudocercospora
گونه جدید
گیاه میزبان
لکه برگی
مهدی
پیرنیا
1
مسئول مکاتبه
AUTHOR
رسول
زارع
simplicillium@yahoo.com
2
نویسنده
AUTHOR
حمیدرضا
زمانیزاده
3
نویسنده
AUTHOR
اکبر
خداپرست
4
نویسنده
AUTHOR
باهره
جوادی
5
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
بررسی تنوع فنوتیپی و ژنوتیپی جدایههای Agrobacterium از میزبانهای مختلف در استانهای فارس و کهگیلویه و بویراحمد
در سالهای 1387 و 1388 از باغهای مو، گلخانههای پرورش گل رز و همچنین مزارع چغندرقند در استانهای فارس و کهگیلویه و بویراحمد بازدید و از گیاهان دارای علایم گال طوقه و ریشه و خاک اطراف آنها نمونهبرداری و به آزمایشگاه منتقل شد. جداسازی عامل بیماری روی محیطهای NA، DIM agar، 1A و RS انجام گرفت. پس از خالصسازی جدایهها، با انجام آزمونهای استاندارد باکتریشناسیجدایهها بهعنوان A. vitis وbiovar 1 A. tumefaciens تشخیص داده شدند. آزمون بیماریزایی روی گیاهان کالانکوئه، گوجهفرنگی و آفتابگردان انجام شد و اکثرجدایهها توانستند در این گیاهان تولید گال کنند. برای تشخیص بیماریزایی جدایهها نیز از آغازگرهای اختصاصی A/C´و VCF/VCR استفاده شدکه بهترتیب تمام جدایهها باندهای 224 و 730 جفت بازی را تکثیر کردند. در بررسی آزمون rep-PCR با استفاده از آغازگرهای BOX و ERIC تنوع زیادی در بین جدایهها مشاهده گردید. جدایههای بهدست آمده از مناطق مختلف استانهای فارس و کهگیلویه و بویراحمد به دو گروه کلی قابل تقسیم بودند. گروه یک نیز به دو زیر گروه تقسیم شد، که یک زیر گروه شامل جدایههای A.vitis (جدا شده از درختان مو) و زیر گروه دیگر شامل جدایههای A. tumefaciens (جدا شده از رز و چغندرقند) بود. گروه دوم نیز تعداد کمی از جدایههای A. tumefaciens (جدا شده از رز و چغندرقند) را شامل شد. حداکثر شباهت در آزمون rep-PCR در داخل گونه A. vitis با حدود 88 درصد بهدست آمد. گروهبندی براساس خصوصیات ژنوتیپی تا حدودی با گروهبندی براساس خصوصیات فنوتیپی مطابقت داشته و آزمونهای فنوتیپی و rep-PCR به خوبی توانستند گونههای A.vitis و A. tumefaciens را از هم تفکیک نمایند.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15649_d6361da82022ce71a21d0326026ce1c2.pdf
2012-12-01
329
341
گال طوقه و ریشه
Agrobacterium
rep-PCR
محمود
شهابی محمدآبادی
1
نویسنده
AUTHOR
سید محسن
تقوی
mtaghavi@shirazu.ic.ir
2
مسئول مکاتبه
AUTHOR
محمد
جواهری
m.djavaheri@gmail.com
3
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
بررسی رابطه دگرپادی بین ویروسهای موزائیک کوتولگی ذرت و موزائیک جنوبی مرغ
دو ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus, MDMV) و موزائیک جنوبی مرغ (Bermuda grass southern mosaic virus, BgSMV) به رغم تفاوت مشخص نود نوکلئوتیدی در ژن پروتئین پوششی، از لحاظ سرولوژیکی و مولکولی شباهت زیادی بههم دارند. در این تحقیق رابطه دگرپادی این دو ویروس مورد بررسی قرار گرفت. این بررسی در قالب 5 تیمار در 5 تکرار (هر تکرار شامل یک گلدان با ده بوته) طراحی شد. تیمارها شامل مایهزنی مکانیکی هر یک از ویروسها به گیاه پس از استقرار ویروس دیگر، مایهزنی توﺃم و مایهزنی دو ویروس بهطور جداگانه بودند. دو هفته بعد از مایهزنی، برای استخراج آرانای ویروس با استفاده از mRNA Capture Kit از تیمارها نمونهبرداری شد. از آرانای ویروس به روش ترانویسی معکوس cDNA تهیه و با جفت آغازگرهای MD3F/MD1R و BgSMF90/ BgSMR90b در آزمون PCR تکثیر شد. نتایج آزمون PCR نشان داد که مایهزنی هر کدام از دو ویروس از تکثیر ویروس دیگر جلوگیری میکند. براساس این آزمون و اطلاعات بیولوژیکی و مولکولی قبلی میتوان نتیجه گرفت که دو ویروس با هم رابطه دگرپادی دارند و بنابراین ممکن است بهرغم تفاوتهای بیولوژیکی و مولکولی، رابطه بسیار نزدیک با هم داشته باشند و یا سویههای یک ویروس محسوب شوند. در این بررسی رابطه دگرپادی ویروس موزائیک ایرانی قیاق (Iranian Johnson grass mosaic virus, IJMV) با دو ویروس BgSMV و MDMV بهعنوان شاهد نیز مطالعه شد که بین آنها هیچ رابطه دگرپادی دیده نشد.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15684_5b5ab2ac340e1fb44d8e38916be2374f.pdf
2012-12-01
343
352
ویروس موزائیک کوتولگی ذرت
ویروس موزائیک جنوبی مرغ
ویروس موزائیک ایرانی قیاق
دگرپادی
عاطفه
ذاکری
1
نویسنده
AUTHOR
محمود
معصومی
masoumi@shirazu.ac.ir
2
مسئول مکاتبه
AUTHOR
سعید
نصرا... نژاد
3
نویسنده
AUTHOR
طاهره
قهرمانی
4
نویسنده
AUTHOR
کرامت اله
ایزدپناه
izadpana@shirazu.ac.ir
5
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
تنوع ژنتیکی جدایههای فیتوپلاسمای همراه با بیماری جاروک بادام دراستانهای فارس، کرمان و کردستان
بیماری جاروک بادام که فیتوپلاسمای همراه با آن Candidatus Phytoplasma phoenicium نام دارد در حال حاضر یکی از مخربترین بیماریهای بادام در ایران و لبنان است. تنوع ژنتیکی در فیتوپلاسمای همراه با جاروک بادام در نمونههای تهیه شده در دو نقطه از باغهای اطراف نیریز (جدایههای نیریز1ونیریز2)، یک نقطه از مشکان نیریز(جدایه مشکان)، دو نقطه در اطراف کرمان (جدایههای کرمان1وکرمان2) ویک نقطه در شهرستان سنندج (جدایه سنندج) بررسی گردید. نهالهای بادام تلخ مایهزنی شده با جدایههای عامل جاروک بادام در شرایط کنترل شده واکنشهای متفاوتی را نشان دادند.RFLP محصول PCR مستقیم با جفت آغازگرP1/P7(تقریباً 1800 جفت باز از اپرون ار.ان.ای ریبوزومی) با آنزیمهای, CfoI, HaeIII, HinfI, HpaII, RsaI, TaqI AluI نشان داد که جدایه مشکان از نظر نقوس حاصل از برش با انزیم CfoI و جدایه کرمان 2 از نظر نقوش حاصل از برش با آنزیمHinfIبا بقیه متفاوتاند و بر این اساس جدایههای مورد مطالعه در 3 گروه قرار میگیرند.جدایه مشکان در گروه یک، جدایه کرمان2 در گروه دو و جدایههای کرمان ا، سنندج، نیریز 1 و نی ریز 2 در گروه سه قرار گرفتند. مقایسه میزان تشابه نوکلئوتیدی در ناحیه SRنیز تفاوت جدایههای عامل جاروک بادام را تأیید کرد و نشان داد که جدایه مشکان با دیگر جدایههای مورد مطالعه تفاوت قابل ملاحظهای دارد.بررسی تبارزایی براساس ترادف اپرون آر ان ای ریبوزومی، جدایههای عامل جاروک بادام را در گروه جاروک نخود کبوتر (16S rIX, Pigeon pea witches' broom)قرار داد و نشان داد که این جدایهها یکسان نیستند. تمامی بررسیهای مولکولی تفاوت جدایه خفر با جدایههای مورد مطالعه در این تحقیق را تأیید کرد. بررسیهای RFLP، مقایسه میزان تشابه نوکلئوتیدی و تبارزایی نشان داد که تفاوت ژنتیکی جدایههای جاروک بادام مربوط به 600 جفت باز از اپرون ار ان ای ریبوزومی شامل انتهای́ 5ژن 16S، ناحیهSR و ابتدای́ 3ژن 23S است.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15686_592e8aaa4e4e83b1cab424945f097a46.pdf
2012-12-01
353
366
جاروک بادام
فیتوپلاسما
تنوع ژنتیکی
حامد
پورعلی
1
نویسنده
AUTHOR
محمد
صالحی
salehi_abarkoohi@yahoo.com
2
مسئول مکاتبه
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
اثرات نماتود ریشهگرهی (Meloidogyne javanica)روی گیاه دارویی بارهنگ کبیر (Plantago major)
گیاهان دارویی همچون گیاه بارهنگ کبیر Plantago major به سبب دارا بودن ترکیبات دارویی گوناگون در صنایع داروسازی از اهمیت زیادی برخوردارند. در این پژوهش ضمن ارزیابی بیماریزایی نماتود ریشهگرهی Meloidogyne javanica بر گیاه بارهنگ کبیر، اثر سطوح مختلف مایه تلقیح اولیه این نماتود روی شاخصهای رشد گیاه میزبان و تکثیر نماتود بررسی شد. در ادامه، محتوای موسیلاژی بذر، مقدار ترکیبات شیمیایی کوئرستین و اسید یورسولیک و همچنین غلظت عناصر سدیم، پتاسیم، منیزیم و کلسیم بارهنگ کبیر در هنگام آلودگی به نماتود، 90 روز پس از تلقیح با نماتود ریشهگرهی بررسی شد. نتایج بهدست آمده از آزمایش حاکی از حساسیت این گیاه به نماتود هدف است. در گیاهان آلوده به نماتود وزن هزار دانه، میزان موسیلاژ بذر و همچنین مقدار اسید یورسولیک کاهش یافت درحالیکه غلظت عناصر سدیم و کلسیم ریشه و ترکیب شیمیایی کوئرستین در اندام هوایی افزایش نشان داد. با افزایش سطح جمعیت نماتود، وزن تر اندام هوایی، طول اندام هوایی و ریشه کاهش یافت در صورتی که وزن تر ریشه افزایش نشان داد. رابطه فاکتور تولید مثلی نماتود با سطوح مختلف جمعیت تلقیح شده معکوس بود به عبارت دیگر بالاترین فاکتور تولید مثلی نماتود در گیاهان تلقیح شده با کمترین سطح از جمعیت نماتود (1000 لارو مرحله دوم (J2) / دو کیلوگرم خاک) دیده شد.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15690_5c50a0b35b040a9af911830559f720cd.pdf
2012-12-01
367
379
نماتود ریشهگرهی
بارهنگ
کوئرستین
اسید یورسولیک
فاطمه السادات
سیدین
1
نویسنده
AUTHOR
مجید
اولیاء
olia100@yahoo.com
2
مسئول مکاتبه
AUTHOR
کامکار
جایمند
3
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
شناسایی و ردیابی جدایههای ایرانی ویروس برگ بادبزنی مو با استفاده از پیوند سبز و آرتی-پیسیآر
ویروس برگ بادبزنی مو (Grapevine fanleaf virus (GFLV)) از مخربترین ویروسهای مو در سراسر جهان میباشد. بهترین روش کنترل خسارت این ویروس جلوگیری از انتشار قلمههای آلوده و نیز استفاده از اندام تکثیری عاری از ویروس برای احداث تاکستانهای جدید میباشد، بنابراین ردیابی دقیق این ویروس از اهمیت بالایی در کنترل آن برخوردار است. به منظور معرفی یک روش حساس در ارزیابی پایههای مادری، طی سال 1387 از گیاهان موی تاکستانهای مناطق مختلف کشور نمونهبرداری انجام و آلودگی آنها بهGFLV با استفاده از DAS-ELISA بررسی شد. سپس آلودگی 14 نمونة الیزا مثبت با استفاده از آرتی-پیسیآر و با بهکارگیری آغازگرهای موجود در منابع و طراحی شده در این پژوهش بررسی شد. نتایج نشان داد که اکثر آغازگرهای موجود در منابع قادر به ردیابی در تمامی نمونههای بررسی شده نبودند. درحالیکه آغازگرهای طراحی شده در این پژوهش ویروس را در همة نمونهها ردیابی کردند. کارایی آغازگرهای طراحی شده روی 35 نمونة الیزا مثبت جمعآوری شده از سایر استانها در سال بعد (1388) بررسی و تأیید شد. همچنین در این پژوهش برای اولینبار روش پیوند سبز برای بررسی آلودگی به GFLV انجام و آلودگی ویروسی را تأیید کرد. نتایج این پژوهش نشان داد که ترکیب پیوند سبز و آرتی-پیسیآر با آغازگرهای معرفی شده در این بررسی روشی دقیق برای ردیابیGFLV است.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15693_e09373271e0d7b62d914110a3ca7d00b.pdf
2012-12-01
381
391
کنترل
الیزا
طراحی آغازگر
شاهین
نورینژاد زرقانی
1
نویسنده
AUTHOR
مسعود
مسعود شمس بخش
2
مسئول مکاتبه
AUTHOR
نعمت
سخندان بشیر
sokhandan@tabrizu.ac.ir
3
نویسنده
AUTHOR
مقصود
پژوهنده
4
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
بررسی اثرات متقابل دو قارچ میکوریز آربوسکولار ) Glomus mosseae وGlomus intraradices ( و نماتود ریشهگرهی ) (Meloidogyne javanica در گوجهفرنگی
در این بررسی برای ارزیابی اثرات متقابل دو قارچ میکوریز آربوسکولار و نماتود ریشهگرهی در گوجهفرنگی از دو قارچ Glomus mosseae و intraradices Glomusو یک گونه نماتود Meloidogyne javanica استفاده شد. پس از تکثیر قارچهای مذکور روی شبدر سفید و تکثیر و شناسایی نماتود، آزمایشی با 6 تیمار و 9 تکرار بهصورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی در شرایط گلخانه انجام شد. برای مطالعه اثر قارچها روی بیماریزایی و خسارت نماتود از شاخصهای رشدی گیاه (ارتفاع اندامهای هوایی، طول ریشه، وزن تر و خشک اندامهای هوایی و ریشه) و شاخصهای رشد و نموی نماتود (تعداد گال و توده تخم روی هر گیاه، تعداد تخم در هر توده تخم، تعداد نوزاد سن دوم در خاک و فاکتور تولیدمثل Rf=Pf/Pi)، و برای ارزیابی اثر نماتود روی قارچهای میکوریز از پارامترهای رشد و نموی قارچ (تعداد اسپور و درصد کلنیزاسیون ریشه) استفاده شد. نتایج نشان داد که قارچهای میکوریز باعث افزایش رشد بخشهای مختلف گیاه میشوند. نتایج بهدست آمده از تجزیه آماری شاخصهای رشد و نموی گیاه و نماتود در تیمارهای مختلف نشان داد که تأثیر قارچها روی کاهش خسارت نماتود بیش از اثر افزایشی روی رشد گیاه است. بین دو قارچ از این نظر تفاوت معنیداری دیده نشد. علیرغم کاهش شاخصهای قارچی (تعداد اسپور در خاک و میزان کلنیزاسیون ریشه) در اثر حضور نماتود، تجزیه و تحلیل آماری شاخصهای مذکور مؤید وجود تفاوت معنیدار بین آنها، در حضور و عدم حضور نماتود نبود.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15712_28ac1ca7fd929cabda15551b27c81b8e.pdf
2012-12-01
393
401
نماتود ریشهگرهی
گوجهفرنگی
اثرات متقابل
همزیستی
فاطمه
سهرابی
1
مسئول مکاتبه
AUTHOR
علیاکبر
فدایی تهرانی
2
نویسنده
AUTHOR
یونس
رضایی دانش
3
نویسنده
AUTHOR
عبدالحسین
جمالی زواره
ahjamaliz@yahoo.com
4
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
خالصسازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس
ویروس موزائیک زرد کدو (Zucchini yellow mosaic virus) ازنمونههای کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه بهعنوان جدایه فارس این ویروس ((ZYMV-F به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. ZYMV-F در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافتهای آلوده برای خالصسازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتیسرمبهدست آمده از آموده خالص ویروس، در آزمونهای سرولوژیکی استفاده شد. با بهرهگیری از روش به دام اندازی آر اِن اِی پیک و آغازگرهای اختصاصی طراحی شده، واکنش ترانویسی معکوس و زنجیرهای پلیمراز (RT-PCR) انجام شد و دی اِن اِیهای تکثیر شده، همسانهسازی و تعیین ترادف شدند. با تجمیع ترادفهای بهدست آمده، ترادف کامل ژنوم ZYMV-F شامل 9591 نوکلئوتید (رسشمار JN183062 در بانک ژن) بهدست آمد. آنالیزهای فیلوژنتیکی براساس ترادف نوکلئوتیدی و آمینو اسیدی ژنوم کامل و هر کدام از ژنها بهطور انفرادی نشان داد که ZYMV-F بیشترین شباهت را به جدایههای اسرائیل و اسلواکی ZYMV دارد. همچنین براساس ترادف قسمتی از ژن پروتئین پوششی، مشخص شد که جدایههای ویروس در ایران در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی شباهت زیادی به هم دارند و جدایه فارس و کرج در یک گروه قرار میگیرند. این اولین گزارش از تعیین ترادف کامل ژنوم ZYMV در ایران و دومین گزارش از منطقه خاور میانه و نزدیک است.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15713_0dfa4604665276b09204fa15dc140f7e.pdf
2012-12-01
403
409
فارس
ویروس موزائیک زرد کدو
خالصسازی ویروس
پوتی ویروس
آنالیز فیلوژنتیک
ژنوم کامل
آرمین
آذرفر
1
نویسنده
AUTHOR
کرامت اله
ایزدپناه
izadpana@shirazu.ac.ir
2
نویسنده
AUTHOR
علیرضا
افشاریفر
alirezaafsharifar@yahoo.com
3
نویسنده
AUTHOR
محمود
معصومی
masoumi@shirazu.ac.ir
4
مسئول مکاتبه
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
ریختشناسی، بیماریزایی و تعیین توالی بخشی از دی اِن اِی ریبوزومی Ceratorhiza hydrophila از روی برنج در ایران
قارچCeratorhiza hydrophila از غلافهای برگ برنج دارای علایم لکههای آبسوخته در شالیزارهای استان گیلان به دفعات جدا شده است. این پژوهش به منظور شناخت خصوصیات ریختشناسی، اثبات بیماریزایی و بررسی جایگاه فیلوژنتیکی و ارتباط آن با سایر قارچهای نزدیک به آن انجام شد. نتایج نشان داد که این قارچ قادر به آلوده کردن بوتهها و ایجاد لکههای آبسوخته تا قهوهای کمرنگ کوچک روی غلاف برگ بعد از یک هفته پس از مایهزنی بود. بررسی ریختشناسی جدایهها نشان داد پرگنه در سطح محیط کشت PDA در ابتدا سفید بوده و در نهایت به رنگ خرمایی تغییر یافت. در سطح تشتک حلقهبندیها و سختینههای تقریباً گرد، منظم و بسیار کوچک ظرف چهار روز پس از کشت به تعداد فراوان تشکیل شدند. رنگ سختینهها در ابتدا سفید بود که با گذشت زمان به رنگ نخودی تا قهوهای تیره تغییر یافت. تجزیه و تجلیل فیلوژنتیک 530 جفت باز از ناحیه ITS (شامل5.8S) نشان داد این قارچ دارای قرابت ژنتیکی بسیار زیادی با گروه ریزوکتونیاها بوده و از گروه Sclerotium جدا میشود که این نتایج با ریختشناسی پرگنه و سختینه قارچ مطابقت دارد. این اولین گزارش از بیماریزایی این قارچ روی برنج از ایران است.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15714_1e194995209ee0f351b43b7b25b557ea.pdf
2012-12-01
411
415
برنج
بیماریزایی
تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی
گیلان
Ceratorhiza hydrophila
ITS rDNA
امیررضا
امیرمیجانی
ar_amirmijani@yahoo.com
1
مسئول مکاتبه
AUTHOR
سیداکبر
خداپرست
khodaparast@guilan.ac.ir
2
نویسنده
AUTHOR
فریدون
پاداشت دهکائی
3
نویسنده
AUTHOR
محمدمهدی
سوهانی
4
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
فراوانی و تعیین ترادف سه جدایه ویروس وای سیبزمینی از مزارع توتون و مقایسه فیلوژنتیکی با سایر جدایههای دنیا
برای تعیین فراوانی ویروس وای سیبزمینی (Potato virus Y, PVY) در تابستان 1389 تعداد 182 نمونه دارای علایم از مزارع توتون استان گلستان جمعآوری و با آزمون DAS-ELISA با آنتی سرم چند همسانهای مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 90 نمونه آلوده به PVY تشخیص داده شدند. آر ان ای سه جدایه ویروس با استفاده از کیت RNX-Plus استخراج و با یک جفت آغازگر اختصاصی PVY مربوط به ناحیه CP، در واکنش RT-PCR تکثیر شد. نمونههای آلوده به PVY پس از الکتروفورز در ژل آگاروز در محدوده bp1000 مورد انتظار، ایجاد باند نمودند. محصول PCR بهطور مستقیم ترادفیابی شد و ترادفهای بهدست آمده به طول850 نوکلئوتید همراه با 30 ترادف انتخاب شده از GenBank مقایسه شدند. همردیفسازی چندگانه و آنالیز فیلوژنتیک با ClustalX و BLAST در نرمافزار BioEdit انجام و درخت فیلوژنتیکی به روش maximum parsimony ترسیم گردید. آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که جدایههای علیآباد و فاضلآباد از ایران همراه با جدایههای اسپانیا، ایتالیا و بوشهر در یک گروه و جدایه مینودشت همراه با جدایههای هلند، بریتانیا و تایوان در گروه دیگر قرار میگیرند.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15715_9eed8582f7fc8b332a5864e9840a0dcd.pdf
2012-12-01
417
421
توتون
ویروس وای سیبزمینی
DAS-ELISA
CP-UTR
آنالیز فیلوژنتیک
فاطمه
زینتی فخرآباد
1
مسئول مکاتبه
AUTHOR
سعید
نصرالله نژاد
2
نویسنده
AUTHOR
اسداله
احمدی خواه
3
نویسنده
AUTHOR
میثم
تقی نسب
4
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
تعیین برخی از ویژگیهای فیتوپلاسمای همراه با بیماری جاروک یونجه در استان بوشهر
به منظور تعیین ویژگیهای فیتوپلاسمای همراه با بیماری جاروک یونجه در استان بوشهر در هر یک از مناطق بنداروز(1جدایه)، سرکره(2جدایه)، پشت پر(1جدایه)و تنگ ارم(1جدایه)یک بوته یونجه با علایم بارز بیماری جاروک انتخاب و به گلخانه انتقال داده شد تا بهعنوان منبع عامل بیماری در مطالعات انتقال عامل بیماری و آزمونهای مولکولی استفاده شود. در گلخانه عامل بیماری جاروک بهوسیله سس از هر بوته یونجه به یک بوته سالم پروانش انتقال داده شدو در پروانشهای مایهزنی شده علایم بیماریهای فیتوپلاسمایی ظاهر شد. از نظر ایجاد علایم در پروانش، جدایههای فیتوپلاسمای جاروک یونجه در استان بوشهر قابل تفکیک نبودند. در آزمون واکنش زنجیرهای پلیمراز(PCR) با استفاده از جفت آغازگر P1/P7در همه جدایهها قطعه مورد انتظار(1800 جفت باز از اپرون ار ان ای ریبوزومی) تکثیر شد.آزمون چند شکلی طول قطعات برشی (RFLP)باآنزیمهای AluI،CfoI،HaeIII،HpaIIو RsaI، نشان داد که براساس 1800 جفت باز از اپرون ار ان ای ریبوزومی جدایههای فیتوپلاسمای جاروک یونجه در استان بوشهر با یکدیگر و با فیتوپلاسماهای عامل جاروک یونجه در فارس (جدایههای جویم 1 و مبارک آباد)و یزد (جدایه ابرکوه) که متعلق به گروه جاروک بادام زمینی(16SrII)هستند، تفاوتی ندارند و فقط از نظر جایگاه آنزیمCfoI با یک جدایه از فارس (جویم2)متفاوتند. جستجو با برنامه BLAST و آنالیز فیلوژنتیکی ترادف محصول PCR با جفت آغازگر P1/P7 نیز نشان داد که عامل جدایه بنداروز بهعنوان نماینده جدایههای فیتوپلاسمای جاروک یونجه در استان بوشهر متعلق به گروه جاروک بادام زمینی است. بیماری جاروک یونجه برای اولینبار از نقاط مختلف استان بوشهر گزارش میشود.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15722_06f3235771caeb039caae2eac92d3aaa.pdf
2012-12-01
423
431
یونجه
جاروک
واکنش زنجیرهای پلیمراز
چند شکلی طولی قطعات برشی
آنالیز تبارزایی
استان بوشهر
داوود
رئوفی
1
نویسنده
AUTHOR
محمد
صالحی
salehi_abarkoohi@yahoo.com
2
مسئول مکاتبه
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
بررسی اثر چند عصاره گیاهی در کنترل بیماری سفیدک پودری خیار
استفاده از ترکیبات طبیعی گیاهان برای کنترل بیماریها، بهدلیل مزایایی که بر ترکیبات شیمیایی سنتزی دارند، مورد توجه و تحقیق قرار گرفته است. در این پژوهش تأثیر پنج عصاره گیاهی شامل عصاره برگ اسفناج، چغندر، ترب، شلغم و فلفل در پیشگیری و درمان بیماری سفیدک پودری خیار در آزمایشات گلخانهای بررسی شده است. بدین منظور عصاره آبی، استونی یا متانولی هر گیاه با غلظتهای 1% و 5%، یک روز قبل یا یک روز بعد از تلقیح بیمارگر روی بوتهها استفاده شد و سپس شدت بیماری براساس تعداد لکهها روی برگ ده روز پس از تلقیح محاسبه گردید. همچنین میزان تأثیر عصارهها در کنترل بیماری، با اثر قارچکش پنکونازول و عصاره گیاه Reynoutria sachalinensis ((Rs، که کاربرد تجاری در کنترل بیماری دارند، مقایسه گردید. نتایج نشان داد که کلیه این عصارهها وقتی با فاصله یک روز از تلقیح بیمارگر روی بوته بهکار رفتند، شدت بیماری را کاهش دادند، گرچه میزان تأثیر آنها متفاوت بود. عصاره استونی 5% فلفل و چغندر و عصاره متانولی 5% اسفناج و شلغم، در مقایسه با عصارهRs، تأثیر نسبی در جلوگیری از آلودگی داشتند. از طرف دیگر، عصاره متانولی 5% شلغم، بیشترین تأثیر را در درمان بیماری داشت و به اندازه قارچکش پنکونازول در درمان بیماری مؤثر بود. همچنین آزمایش نشان داد که 24 ساعت قبل از تلقیح، بهترین زمان کاربرد عصارههای اسفناج و Rs، برای کنترل بیماری است و کاربرد عصارههای فلفل و شلغم، 24 ساعت پس از تلقیح در کنترل بیماری مؤثرتر است. لذا درجه تأثیر عصارهها، تحتتأثیر زمان کاربرد، غلظت و نوع حلال قرار میگیرد.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15723_34ee5427de314f45b80914e834651e87.pdf
2012-12-01
433
437
Podosphaera fusca
عصارههای گیاهی
قارچکش پنکونازول
Reynoutria sachalinensis
اعظم
سیروس
1
مسئول مکاتبه
AUTHOR
عبدالحسین
جمالی زواره
ahjamaliz@yahoo.com
2
نویسنده
AUTHOR
علیاکبر
فدایی تهرانی
3
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
همراهی توأم چند ویروئید مرکبات با علایم بیماریهای پسوروز و نقش حلقوی در مرکبات استان مازندران
مرکبات از محصولات باغی مهم و استراتژیک در کشاورزی ایران به شمار میآید. در بین استانهای مرکباتخیز ایران، استان مازندران بیشترین سطح زیر کشت مرکبات (حدود 100 هزار هکتار) و تولید و تنوع ارقام را به خود اختصاص داده است. تنوع ارقام وارداتی از یکسو و تکثیر پیوندی نهالها از سوی دیگر موجب بروز و انتشار بیماریهای متعددی در این منطقه شده است بهطوریکه علایم بسیاری از بیماریهای ویروسی و شبهویروسی در باغهای مرکبات آن مشاهده گردید. با وجود این، عوامل احتمالی برخی بیماریهای شبهویروسی نظیر نقشحلقوی (citrus ring pattern) در مرکبات مازندران نامعین مانده و بهکارگیری پیوندکهای گواهی شده عاری از بیماری چندان مورد توجه عموم قرار نگرفته بوده است. اما در یک دهه اخیر با شروع انتقال ویروس تریستزا توسط شته در مازندران، تمایل باغداران این منطقه به استفاده از پایههای متحمل به تریستزا خصوصاً پونسیروس (Poncirus trifoliata) و دورگههای آن نظیر سیترنج (P. trifoliata × Citrus sinensis) و سیتروملو (P. trifoliata × C. paradisi) و همچنین استفاده از منابع پیوندک عاری از بیماری (بالاخص ویروس تریستزا) افزایش پیدا کرده است. در سوی دیگر، برخی باغداران و تولیدکنندگان نهالهای مرکبات نسبت به اثر ویروئیدهایی که تاکنون در ارقام مرکبات بر روی پایه نارنج بیاثر یا بیضرر مانده اما در پایههای پونسیروس و دورگهای آن سبب کاهش اندازه و میزان محصول میگردند نگران گردیدهاند. بررسیهای مقدماتی انجام شده در زمینه ردیابی ویروس پسوروز مرکبات در درختان دارای علایم نقش حلقوی و پسوروز در شرایط باغ و در گیاهان پیوند شده در گلخانه نتایج مثبتی در پی نداشته و محصول اختصاصی مربوط به ویروس پسوروز مرکبات با PCR قابل تکثیر نبوده است.
با توجه به اهمیت موضوع، به منظور ردیابی ویروس و ویروئیدهای مولد یا همراه بیماریهای پسوروز (scaly bark psorosis) و نقش حلقوی مرکبات، پیوندکهایی از شاخههای آلوده نارنگی انشو (C. unshiu, Satsuma mandarin) تهیه و روی نهال یکساله بالنگ اتراگ (C. medica, Etrog) رقم Arizona 861-S1 و گیاه دوساله پرتقال نافدار واشنگتن (Washington navel) که بر روی پایه نارنج تکثیر شدند پیوند زده شد. گیاهان پیوند خورده در شرایط گلخانه با دمای 30-22 درجه سلسیوس نگهداری و بهصورت ماهانه جهت مشاهده علایم بازبینی میشدند. علایم نقش میخی در برگهای همه گیاهان پیوندخورده با منبع پیوندک آلوده به پسوروز بعد از گذشت یک تا سه ماه مشاهده شد. رگبرگ روشنی و خمیدگی برگ در نهالهای بالنگ اتراگ آلوده شده با پیوندکهای نقش حلقوی مشاهده گردید. نهالهای پرتقال مایهزنی شده با بیماری نقشحلقوی نیز نقوش خطی و حلقوی را پس از گذشت چهار سال از زمان پیوندزنی نشان دادند. بعد از حدود یکسال، نمونههای آر ان ا از بافتهای آلوده شده نهالهای پرتقال و بالنگ اتراگ با استفاده از ماده ترایزول (TRIzol, Invitrogen) استخراج و در واکنش زنجیرهای پلیمراز با نسخهبرداری معکوس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروئیدها و ویروس پسوروز مرکبات مورد ارزیابی واقع شد. نتایج حاصل از الکتروفورز محصول RT-PCR بر روی ژل آگاروز 5/1% در حضور نمونه شاهد ویروئیدهای مرکبات نمایانگر حضور ویروئیدهای خمیدگی برگ، کوتولگی (ویروئید 3، قبلی)، ترکخوردگی پوست (ویروئید 4، قبلی) و ویروئید 6 مرکبات (OS قبلی) و ویروئید کوتولگی رازک در نمونههای آلوده به بیماریهای نقش حلقوی و پسوروز مرکبات بودند. هیچ نواری از ویروئید اگزوکورتیس مرکبات در نمونههای بررسی شده ردیابی نشد. این اولین گزارش از حضور همزمان ویروئیدهای مرکبات همراه با بیماریهای پسوروز و نقش حلقوی مرکبات در ایران است.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15724_526c0e80fa8ae085f9db1c355bd85a47.pdf
2012-12-01
439
440
سید محمد
علوی
1
نویسنده
AUTHOR
حشمتاله
رحیمیان
2
نویسنده
AUTHOR
ORIGINAL_ARTICLE
بررسی امکان همزیستی و ارزیابی تأثیر قارچ اندومایکوریز Piriformospora indica در گیاه برنج
قارچهای میکوریز از مهمترین میکروارگانیسمهای خاک محسوبمیشوندکه با ایجاد تغییرات ژنتیکی، فیزیولوژیکی و اکولوژیکی در گیاهان میزبان خود، عملکرد آنها رادر واحد سطح افزایش میدهند. قارچ اندومیکوریز Piriformospora indica Sav. Verma, Aj. Varma, Rexer, G. Kost & P. Franken 1998متعلق به گروه قارچهای میکوریز در راسته Sebacinales، رده Hymenomycetes و شاخه بازیدیومیکوتا میباشد و روی ریشه تعدادی از گیاهان تک لپهای تیره Poaceae و گیاهان دو لپهای تیره Brassicaceae و Chenopodiaceae گزارش شده است. بررسیهای متعدد نشان داده است که این قارچ موجب افزایش طول ریشه و اندام هوایی گیاه از طریق تحریک گیاه در تولید هورمونهای رشدی، افزایش جذب برخی از عناصر غذایی مانند فسفر و تحمل بیشتر گیاه به تنشهای خشکی و شوری میشود. این قارچ همچنین موجب القاء مقاومت سیستمیک علیه عوامل بیمارگر ریشه، ساقه و برگ در برخی گیاهان شده که منجر به افزایش عملکرد میشود. در این بررسی جدایه قارچ P. indica (اهدایی پروفسور کوژل، رئیس موسسه بیماریشناسی و جانورشناسی کاربردی دانشگاه گیزن آلمان) در محیط کشت جامد اختصاصی (CM)Complex medium بهمدت یک ماه در دمای Co27 نگه داشته شد. بذور برنج رقم طارم محلی پس از ضدعفونی سطحی با محلول هیپو کلرید سدیم 1 درصد روی کاغذ صافی مرطوب در تشتکهای پتری سترون بهمدت 72 ساعت جوانهدار شدند. ریشه گیاهچههای 4 روزه در سوسپانسیون ml–16 10 کلامیدوسپور قارچ غوطهور و بهمدت 12 ساعت در دمای محیط با دور rpm 40 تکان داده شد. گیاهچهها در ظروف حاوی محیط آبی یوشیدا جهت رشد تا زمان نشاء قرار گرفتند. گیاهچههای تیمار شده با قارچ اندوفیت و گیاهچههای تیمار نشده (شاهد) در قالب طرح کاملاً تصادفی در 3 تکرار در گلدان مورد ارزیابی قرار گرفتند. برای ردیابی قارچ از رنگآمیزی ریشه گیاهان تیمار شده براساس روش ویرهیلیگ و همکاران با اندک تغییراستفاده شد. ردیابی مولکولی قارچ با استفاده ازآغازگر اختصاصی (accession no. AJ249911) Tef انجام شد. نتایج نمایانگر حضور کلامیدوسپورهای گرد تا گلابی شکل در بافت کورتکس ریشه و نوالی معادل با بخشی از ژن Tef قارچ P. indica با آغازگر مورد استفاده در ریشههای تلقیحی بود. در گیاهان تیمار شده با P. indica، پنجهزنی گیاه تا 50 درصد افزایش یافت. همچنین تعداد خوشههای بارور و طول ریشه در مقایسه با شاهد افزایش قابل ملاحظهای را نشان داد. مطالعه امکان القای مقاومت در برابر عوامل بیماریزا توسط قارچ میکوریز در گیاه برنج در دست بررسی است. این اولین مطالعه از امکان همزیستی قارچ P. indica با رقم ایرانی برنج میباشد.
https://ijpp.areeo.ac.ir/article_15725_b561ac06efeff7132f811d949e60926b.pdf
2012-12-01
441
442
سید حسین
موسوی
1
نویسنده
AUTHOR
بهرام
شریفنبی
2
نویسنده
AUTHOR
ولیاله
بابایی زاد
3
نویسنده
AUTHOR
سید محمد
علوی
4
نویسنده
AUTHOR
محمدعلی
تاجیک قنبری
m.tajick@gmail.com
5
نویسنده
AUTHOR
امیر
مساح
amassah@cc.iut.ac.ir
6
نویسنده
AUTHOR