انجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622Phenotypic and genetic properties of Ralstonia solanacearum strains, the causal agent of bacterial wilt of potato isolated from Kurdistan province*بررسی خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های Ralstonia solanacearum عامل بیماری پژمردگی باکتریائی سیب زمینی جداشده از استان کردستان*11327314FAسحر پیرهکارشناسی ارشد گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستانبهروز حریقیدانشیار گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستانJournal Article20160206Phenotypic properties and genetic diversity of 24 strains of <em>Ralstonia solanacearum </em>causing bacterial wilt of potato plants isolated from various locations in Kurdistan province was investigated. According to physiological and biochemical properties, 19 and 5 of isolates were identified as <em>R. solanacearum </em>biovar 2 and 3, respectively. Identification of isolates was further confirmed by PCR using 759/760 primers specific to <em>R. Solanasearum</em>. Based on multiplex PCR, all strains identified as biovar 2 were belonging to phylotype II. In multiplex PCR, strains identified as biovar 3 produced <em>R. solanacearum </em>species-specific fragment but failed to produce expected phylotype-specific amplicon. Genetic diversity of selected strains was investigated by rep-PCR fingerprinting using REP, ERIC and BOX primers. UPGMA analysis of combined data obtained from rep-PCR fingerprint pattern using Dice<sup>,</sup>s coefficient revealed the strains could be separated into 5 groups at a similarity level of approximately 43%. There was no direct relationship between geographic locations of strains and grouping. Obtained results demonstrated the existence of a genetic diversity among <em>R. solanacearum</em> strains causing bacterial wilt disease of potato in Kurdistan province.ویژگی های فنوتیپی و تنوع ژنتیکی 24 جدایه باکتری <em>Ralstonia solanacearum</em> عامل بیماری پژمردگی باکتریائی سیب زمینی جدا شده از مناطق مختلف استان کردستان مورد بررسی قرار گرفت. براساس خصوصیات فیزیولوژیک و بیوشیمیائی، 19جدایه <em>R. solanacearum</em> بعنوانبیووار 2 تشخیص داده شدند. پنج جدایه، خصوصیات فنوتیپی بیووار 3 را دارا بودند. صحت تشخیص تمامی جدایه ها در سطح گونه توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز و با استفاده از آغازگرهای 759/760 اختصاصی گونه مورد تایید قرار گرفت. در مطالعه جدایه ها با استفاده از روش (Pmx) Multiplex PCR، تمامی جدایه های تشخیص داده شده تحت عنوان بیووار 2 با تکثیر باندهائی با اندازه تقریبی 282 و 372 جفت باز در فیلوتیپ II قرار گرفتند. پنج جدایه با خصوصیات فنوتیپی شبیه به بیووار3، در واکنش Pmx باند اختصاصی گونه به اندازه تقریبی 282 جفت باز به اضافه باند با اندازه تقریبی 191 جفت باز تکثیر نمودند که اختصاصی هیچکدام از گروه های فیلوتیپی نمی باشد. نوع ژنتیکی جدایه ها به روش rep-PCR و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی REP، ERIC و BOX مورد بررسی قرار گرفت. آنالیز ترکیبی داده با استفاده از هرسه آغازگر به روش UPGMA و براساس ضریب تشابه دایس نشان داد که جدایه ها در سطح تشابه 43% به 5 گروه قابل تفکیک هستند. ارتباط مشخصی بین گروه بندی بدست آمده و منطقه جغرافیائی جدایه ها مشاهده نشد. نتایج حاصل از این تحقیق نشاندهنده تنوع ژنتیکی در جدایه های <em>R. solanacearum</em>جداسازی شده از استان مورد مطالعه می باشد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27314_29ce81dd2140ad8e478f693c1c9a8220.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622Effect of combined application of Pseudomonas fluorescens CHA0 and chemical fertilizers on the activity of root-knot nematode, Meloidogyne incognita, and infected tomato plant in greenhouse*اثر کاربرد تلفیقی باکتری Pseudomonas fluorescens CHA0 و کودهای شیمیایی بر فعالیّت نماتود ریشهگرهی Meloidogyne incognita در گیاه گوجهفرنگی آلوده به آن در شرایط گلخانه153027315FAمهشید ساعدیدانش آموخته بخش گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازاکبر کارگربیدهاستاد بیماریشناسی گیاهی، بخش گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز0000-0002-2041-816Xسیدمحسن تقویاستاد بیماریشناسی گیاهی، بخش گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازJournal Article20160713Effects of chemical fertilizers on <em>Meloidogyne incognita </em>activity and <em>Pseudomonas fluorescens</em> CHA0 were studied in vitro. The results showed that the chemical fertilizers increased 67.0-94.8% mortality of the second stage juveniles and decreased 43.8-80.8% egg hatching of the nematode, but did not inhibit the bacterium growth on NA and LB culture + fertilizer. Effect of combined application of <em>P. fluorescens</em> CHA0 and chemical fertilizers, on the activity of <em>M. incognita </em>and growth indices of infected tomato plant cv. Early Urbana was studied in greenhouse in three turns. Results showed that application of triple superphosphate, sulphur, zinc sulphate and copper sulphate in combination with <em>P. fluorescnse</em> CHA0 significantly increased the growth parameters of tomato plants. In the first trial, combination of the bacterium with 50 mg/kg of nitrogen (urea) caused 54.9% and 67.3% reductions in galls and egg masses/gram of root, respectively, and with 10 mg/kg of phosphorus caused 18% reduction in reproduction factor (RF) of the nematode. In the second trial, the bacterium and 5 mg/kg of cupper caused 83.2% and 80.6% reductions in galls and egg masses/gram of root, respectively, and with 100 mg/kg of nitrogen caused 81.7% reduction in RF. In the third trial, the bacterium and 5 mg/kg of cupper caused 74.7% and 81.2% reductions in galls and egg masses/gram of root, respectively, and with 100 mg/kg of nitrogen caused 67.6% reduction in RF. Combination of <em>P</em>. <em>fluorescens</em> CHA0 and copper sulphate was the best treatment in increasing tomato growth parameters and decreasing the nematode indices.تأثیر کودهای شیمیایی بر فعالیّت نماتود ریشهگرهی <em>Meloidogyne incognita</em> و جدایه <em>Pseudomonas</em> <em>fluorescens</em> CHA0 در شرایط آزمایشگاه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که کودهای شیمیایی باعث افزایش 0/67-8/94% مرگومیر لارو سن دو و کاهش 8/43-8/80% تفریخ تخم نماتود نسبت به شاهد شدند ولی مانع رشد باکتری روی محیط کشت NA + کود و LB + کود نشدند. تأثیر کودهای شیمیایی در تلفیق با باکتری بر فعالیّت نماتود و شاخصهای رشدی گیاه گوجهفرنگی رقم ارلیاربانا آلوده به آن، در سه آزمون مجزا در خاک سترون در گلخانه مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که کودهای سوپرفسفاتتریپل، گوگرد، سولفات روی و سولفات مس در تلفیق با باکتری باعث افزایش معنیدار شاخصهای رشدی گوجهفرنگی در مقایسه با شاهد شدند. در آزمون اول، کاربرد باکتری و 50 میلیگرم/کیلوگرم نیتروژن (منبع اوره) باعث کاهش 9/54% و 3/67% تعداد گال و کیسه تخم/گرم ریشه، و تیمار باکتری با 10 میلیگرم فسفر باعث کاهش 18% فاکتور تولیدمثل نماتود گردید. در آزمون دوم، تعداد گال و تعداد کیسه تخم/گرم ریشه در تیمار باکتری و پنج میلیگرم/کیلوگرم مس به ترتیب، 2/83% و 6/80% کاهش یافت. همچنین تیمار باکتری و نیتروژن 100 میلیگرم/کیلوگرم باعث کاهش 7/81% فاکتور تولیدمثل گردید. در آزمون سوم تیمار باکتری و پنج میلیگرم/کیلوگرم مس به ترتیب، باعث کاهش 7/74% و 2/81% تعداد گال و تعداد کیسه تخم/گرم ریشه شد. همچنین تیمار باکتری و 100 میلیگرم/کیلوگرم نیتروژن باعث کاهش 7/67% فاکتور تولیدمثل گردید. بیشترین افزایش شاخصهای رشدی گیاه و کاهش شاخصهای نماتود از کاربرد باکتری و سولفاتمس حاصل شد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27315_3876ec476218b7fe09c9f7e5ef62e0c9.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622Taxonomy, Phylogeny and Pathogenicity of Pythium Species in Rice Paddy Fields of Fars Provinceتاکسونومی، فیلوژنی و بیماریزایی گونههای Pythium در شالیزارهای برنج استان فارس315327316FAفاطمه سلمانی نژاددانش آموخته دانشگاه شیرازرضا مستوفی زاده قلمفرساعضو هیئت علمی/دانشگاه شیراز0000-0001-5572-918XJournal Article20161010In order to investigate the Pythium species of the rice paddy fields of Fars Province, Iran during 2013 to 2015, infected roots and crowns together with soil around seedlings and irrigation water were sampled. According to the morphological, morphometrical and physiological studies along with phylogenetic analyses based on internal transcribed spacer (ITS) of ribosomal DNA, fourteen <em>Pythium </em>species including <em>Py. aphanidermatum</em>, <em>Py. catenulatum</em>, <em>Py. coloratum</em>, <em>Py. debaryanum</em>, <em>Py. dissotocum</em>, <em>Py. hydnosporum</em>, <em>Py. inflatum</em>, <em>Py. kashmirense</em>, <em>Py. nunn</em>, <em>Py. oopapillum</em>, <em>Py. plurisporium</em>, <em>Py. porphyrae</em>, <em>Py. pyrilobum</em>, and <em>Py. rhizo-oryzae</em> were identified. All species are reported for the first time in the world from rice rhizosphere except <em>Py. dissotocum, Py. inflatum </em>and <em>Py. rhizo-oryzae. </em><em>Pythium oopapillum</em>, <em>Py. plurisporium</em>, <em>Py. porphyrae</em> and <em>Py. rhizo-oryzae </em>were new to Iran. <em>Pythium aphanidermatum</em>, <em>Py. rhizo-oryzae </em>and <em>Py. catenulatum </em>were the most abundant species. Pathogenicity of <em>Py. debaryanum</em>, <em>Py. oopapillum</em>, <em>Py. porphyrae</em>, <em>Py. plurisporium </em>and <em>Py. rhizo-oryzae </em>on rice plants were reported in this study for the first time, worldwide.به منظور بررسی گونههای پیتیومی شالیزارهای برنج استان فارس طی سالهای 1392 تا 1394 از خاک، آب آبیاری، ریشه و طوقهی گیاهان بیمار نمونهبرداری انجام گرفت. بر اساس نتایج حاصل ازمطالعات ریختشناختی، ریختسنجی و فیزیولوژیکی جدایهها به همراه بررسیهای فیلوژنتیکی فاصلهی ترانویسیشدهی داخلی (آیتیاِس) دیاِناِی ریبوزومی با روش پیوست همسایهها، 14 گونهی <em>Pythium</em> شامل <em>Py. aphanidermatum</em>، <em>Py. catenulatum</em>، <em>Py. coloratum</em>، <em>Py. debaryanum</em>، <em>Py. dissotocum</em>، <em>Py. hydnosporum</em>، <em>Py. inflatum</em>، <em>Py. kashmirense</em>، <em>Py. nunn</em>، <em>Py. oopapillum</em>، <em>Py. plurisporium</em>، <em>Py. porphyrae</em>، <em>Py. pyrilobum</em> و <em>Py. rhizo-oryzae</em> شناسایی شد. تمامی گونههای یاد شده، به جز گونههای <em>Py. dissotocum</em>، <em>Py. inflatum</em> و <em>Py. rhizo-oryzae</em><em>، </em>برای نخستینبار از فراریشهی برنج در دنیا گزارش میشوند. گونههای <em>Py. oopapillum</em>، <em>Py. plurisporium</em>، <em>Py. porphyrae</em>، <em>Py. rhizo-oryzae</em> برای ایران جدیدند. فراوانترین گونههای جداشده <em>Py. aphanidermatum</em>، <em>Py. rhizo-oryzae</em> و <em>Py. catenulatum</em> بودند. بیماریزایی گونههای <em>Py. debaryanum</em>، <em>Py. oopapillum</em>، <em>Py. plurisporium</em>، <em>Py. porphyrae</em> و <em>Py. rhizo-oryzae</em> روی برنج برای نخستینبار در دنیا گزارش میشود.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27316_666ff972f7ee15493220c8822140c9e5.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622Serological relationship among three phytoplasma strains belonging to the group 16SrII in Iranارتباط سرولوژیکی میان سه استرین فیتوپلاسمایی از گروه 16SrII در ایران516227317FAمجید صیامپور صیامپوراستادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکردکرامت اله ایزدپناهاستاد مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازJournal Article20161031Phytoplasmas are among the most important plant pathogens belonging to the class <em>Mollicutes</em>. In this study the serological relatedness of three 16SrII- related phytoplasmas including lime witches’ broom (LWB; 16SrII-B), alfalfa witches’ broom (AlfWB, 16SrII-C) and cucumber phyllody (CuPh; 16SrII-D) phytoplasmas was examined. A recombinant antibody raised against the Immunodominant membrane protein of the LWB phytoplasma was used in indirect ELISA. Results showed that the produced antiserum reacted with the LWB and AlfWB phytoplasma infected samples, although with lower absorption rate with the later. Under the same conditions, the mean OD obtained from periwinkle extracts infected with CuPh phytoplasma was not significantly different from that of healthy periwinkle. With the antiserum raised against AlfWB phytoplasma, however, the OD value obtained with AlfWB phytoplasma was higher than that obtained with LWB phytoplasma samples. These data suggest that LWB and AlfWB phytoplasmas but not CuPh phytoplasma are serologically related, although not identical. In this study we compared the results of ELISA test and western blot analysis. The serological variation was also compared with Imp and DnaD sequence variability. AS serological distinction is an important criterion for description of new phytoplasma species within a 16S rRNA group, results of this study argues that phytoplasmas of 16SrII-D (CuPh phytoplasma) and II-B (LWB phytoplasma) could be accommodated within two species. However, further evidences are needed to support this argument. <br /> فیتوپلاسماها شامل گروهی از بیمارگرهای مهم گیاهی از رده مولیکوتها هستند. در این مطالعه ارتباط سرولوژیکی سه فیتوپلاسما از گروه 16SrII شامل فیتوپلاسماهای جاروک لیموترش( زیر گروه 16srII-B)، جاروک یونجه (زیر گروه 16SrII-C) و فیلودی خیار (زیرگروه 16SrII-D) مورد بررسی قرار گرفت. در این ارتباط از آنتی سرم نوترکیب تولید شده بر علیه پروتئین غشاء فیتوپلاسمای جاروک لیموترش در الیزای غیر مستقیم استفاده شد . آنتی سرم مذکور قادر به شناسایی نمونه های پروانش آلوده به فیتوپلاسمای جاروک لیموترش و فیتوپلاسمای جاروک یونجه (با میانگین جذب نوری کمتر) بود لکن بین میانگین جذب نوری عصاره گیاه آلوده به فیتوپلاسمای فیلودی خیار و گیاه سالم تفاوت معنی داری مشاهده نشد. هنگامی که در آزمون الیزا از آنتی سرم فیتوپلاسمای جاروک یونجه استفاده شد، میانگین جذب عصاره گیاه مبتلا به فیتوپلاسمای خودی بیشتر از میانگین جذب عصاره آلوده به فیتوپلاسمای جاروک لیمو ترش بود. با توجه به این نتایج، دو فیتو پلاسمای جاروک لیموترش و جاروک یونجه با یکدیگر ارتباط سرولوژیکی داشتند هر چند مقادیر جذب نوری در آزمون الیزا بین این دو فیتوپلاسما از نظر آماری متفاوت بود. در این مطالعه نتایج بدست آمده در آزمون الیزا با نتایج آزمون لکه برداری وسترن مقایسه شد و ارتباط آن با تنوع ژنتیکی ژن Imp مورد بحث قرار گرفته است.با توجه به اهمیت تعیین ارتباط سرولوژیکی بین فیتوپلاسماها برای شناسایی گونه های جدید، احتمال می رود که فیتوپلاسماهای زیرگروه 16SrII-B (جاروک لیموترش) و فیتوپلاسماهای زیرگروه 16SrII-D متعلق به گونه های متفاوتی باشند. با این وجود برای اثبات این فرضیه به شواهد بیشتری نیاز استhttps://ijpp.areeo.ac.ir/article_27317_2a4aa074e2660d96934635b1e6f60de4.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622Altered expression of autophagy-related genes in Nicotiana benthamiana plants in response to Potato virus A HC-Pro silencing suppressorتغییر بیان ژنهای مرتبط با اتوفاژی در پاسخ به سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب زمینی (Potato virus A) در گیاه Nicotiana benthamiana637427318FAامینالله طهماسبیدانشجویان دکتری، مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز.علیرضا افشاریفردانشیار مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازسمیرا ربیعیدانشجویان دکتری، مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز.کرامت ایزدپناهاستاد مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز.Journal Article20161230Accumulating data have revealed the role of autophagy in virus-induced RNA silencing via viral RNA silencing suppressor activity. To extend our understanding for the possible role of <em>Potato virus A</em>-HC-Pro (PVA-HC-Pro) suppressor protein in autophagy process, we investigated the effect of PVA-HC-Pro on expression of some important genes involved in autophagy. The cDNA of ORF PVA HC-Pro was cloned in pGWB17 vector with a C-terminal myc tag and N-terminal 35S promoter using Gateway technology. Agrobacterium cultures harboring PVA-HC-Pro were infiltrated into the abaxial side of <em>N. benthamiana</em> leaves. The expression of <em>ATG6</em>, <em>ATG2</em>, <em>ATG7</em> and <em>AGO1 </em>genes were measured at 5 days post infiltration in response to PVA-HC-Pro using qRT-PCR technique. PVA HC-Pro as a suppressor of RNA silencing increased the expression level of <em>ATG6</em>, <em>ATG2</em> and <em>ATG7</em> 5.89, 7.3 and 7.6 fold, respectively, compared to corresponding values in leaves infiltrated with empty plasmid (EP) as a control. In contrast, the transcript level of <em>Argonaute1</em> (<em>AGO1</em>), a key component of RNA-induced silencing complex (RISC), was decreased by 1.36-fold compared to the level of <em>AGO1</em>in infiltrated leaves without PVA-HC-Pro. Results of this study indicated that PVA HC-Pro can alter the expression of autophagy related genes in <em>N. benthamiana </em>plant. These findings suggest the involvement of ATG6, ATG2, ATG7 and AGO1 in defense responses of <em>N. benthamiana</em> against PVA-HC-Pro, which might be considered in plant breeding programs as a novel approach to the control of plant viruses.در سالهای اخیر نقش اتوفاژی در خاموشی آرانای القاء شده توسط ویروس از طریق فعالیت پروتئینهای سرکوبگر خاموشی آرانای به اثبات رسیده است. به منظور درک بهتر نقش احتمالی سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب زمینی در فرآیند اتوفاژی (autophagy)، اثر این سرکوبگر ویروسی روی بیان تعدادی از ژنهای مهم و دخیل در اتوفاژی مورد بررسی قرار گرفت. ژن<em>HC-Pro </em><em> </em>ویروس ای سیب زمینی در ناقل بیان pGWB17 با برچسبmyc در انتهای کربوکسیلی و پروموتور 35S در انتهای آمینی توسط تکنولوژی gatewayهمسانهسازی شد. کشتهای اگروباکتریوم حاوی HC-Proویروس ای سیب زمینی با استفاده از سرنگ در ناحیه پشتی برگهای گیاه <em>Nicotiana benthamiana</em>تزریق شدند. بیان ژنهای <em>ATG2</em>، <em>ATG7</em>، <em>ATG6</em>و <em>AGO1</em>در پاسخ به سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب زمینی، در فاصله زمانی پنج روز پس از تزریق، با استفاده از تکنیک ریل تایم پیسیآر (Real-Time PCR) اندازهگیری شدند. سرکوبگر خاموشیHC-Pro ویروس ای سیب زمینی میزان بیان ژنهای <em>ATG6</em>، <em>ATG2</em>و <em>ATG7</em>را به میزان ۸۹/۵، ۳/۷ و ۶/۷ برابر نسبت به برگهای تزریق شده با سازه حاوی پلاسمید خالی pGWB افزایش داد. در حالیکه میزان رونوشت <em>AGO1</em>بهعنوان جزء کلیدی کمپلکس خاموشی القاء شده توسط آرانای، به میزان ۳۶/۱ برابر نسبت به میزان آن در برگهای فاقد HC-Proکاهش نشان داد. نتایج این تحقیق حاکی از دخالت ژنهای <em>ATG2</em>، <em>ATG7</em>، <em>ATG6</em>و <em>AGO1</em>در پاسخهای دفاعی گیاه <em>N .benthamiana</em>در مقابل سرکوبگر خاموشی HC-Pro ویروس ای سیب زمینی و امکان استفاده از آن در تدوین روشهای جدید مدیریت ویروسهای گیاهی میباشد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27318_30df56c065edf152acfbed79aa51b213.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622Study of partial biological and behavioral traits of Hishimonus phycitis, vector of lime witches’ broom, for management of the diseaseتعیین برخی ویژگیهای زیستی و رفتاری زنجرک Hishimonus phycitis، ناقل بیماری جاروک لیموترش با هدف مدیریت بیماری759627319FAمحمد صالحیدانشیار پژوهش بخش تحقیقات گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی فارس، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی0000-0002-6169-56499عبدالنبی باقریاستادیار پژوهش بخش تحقیقات گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی هرمزگان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزیمحمدمهدی فقیهیاستادیار پژوهش بخش تحقیقات گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی هرمزگان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزیکرامتالله ایزدپناهاستاد بیماری شناسی بخش گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیرازJournal Article20170113Witches’ broom disease of lime (WBDL) is a serious threat to lime industry in Iranian southern provinces. Vector identification and transmission characteristics are main factors in epidemiology and management of phytoplasma diseases including WBDL. Investigation of the collected sucking insect fauna on witches’ broom infected lime trees in Hashtbandee, Minab and Roodan (Hormozgan province) using PCR and RFLP assays showed that <em>Hishimonus phycitis </em>leafhopper and<em> Diaphorina citri</em> were positive for '<em>Ca</em>. Phytoplasma aurantifolia' presence. However, only <em>H. phycitis</em>, previously identified as vector of WBDL, successfully transmitted the phytoplasma to Bakraee (<em>Citrus reticulate</em> hybrid) seedlings and bearing lime trees. Host range studies showed that <em>H. phycitis </em>can reproduce only on citrus and ziziphus species and was unable to reproduce on eggplant, watermelon, alfalfa and carrot, reported hosts of <em>H. phycitis</em> in india. Results of population fluctuation revealed a main peak for the <em>H. phycitis</em> from February to March. However, the lowest population density was observed in warm months (May to October). The population density of vector on healthy and witches’ broom affected trees was compared and the results revealed that the population density of vector was significantly higher on witches’ broom affected trees than healthy ones. It can demonstrate that in affected lime trees, witches’ broom branches can prepare appropriate niche for <em>H. phycitis</em> reproduction. On the basis of the above data, it is possible to predict that cutting of witches’ broom can be an effective approach for reduction of vector population and WBDL management.تعیین ناقل و ویژگیهای انتقال یکی از فاکتورهای کلیدی در مطالعه اپیدمیولوژی و کنترل بیماریهای فیتوپلاسمایی از جمله بیماری فیتوپلاسمایی جاروک لیموترش میباشد. تحقیق حاضر با هدف شناسایی ناقل/ناقلین بیماری جاروک لیموترش و بررسی برخی ویژگیهای ناقل این بیماری طی سالهای 90-1385 در استانهای هرمزگان و فارس انجام شد. بررسیهای به عمل آمده در مورد حشرات مکنده جمع آوری شده در باغهای آلوده هشتبندی، میناب و رودان (استان هرمزگان) با استفاده از آزمون پیسیآر و RFLP نشان داد که فیتوپلاسمای مزبور تنها در بدن زنجرک <em>Hishimonus phycitis</em> و پسیل آسیایی مرکبات (<em>Diaphorina citri</em>) وجود دارد ولی تنها زنجرک<em>H. Phycitis </em> که پیشتر به عنوان ناقل معرفی شده قادر به انتقال فیتوپلاسما میباشد. زنجرک<em> H. Phycitis </em> در شرایط طبیعی فقط از روی لیموترش و بکرایی جمع آوری شد در صورتیکه در شرایط گلخانه، این زنجرک زیر سرپوش پلاستیکی روی کنار و گونههای مختلف مرکبات تکثیرشد. زنجرک ناقل روی گیاهان علفی شامل بادنجان، هندوانه، هویج ویونجه که در هند به عنوان میزبان این زنجرک گزارش شدهاند، تکثیر نشد. جمعیت زنجرک ناقل در ماههای بسیار گرم (خرداد تا آبان) روی درختان لیموترش بسیار پایین بود ولی با خنک شدن هوا، جمعیت آن به تدریج افزایش یافت به طوریکه در اواخر زمستان و بهار به بیشترین تعداد رسید. جمعیت حشره ناقل روی درختان آلوده لیموترش با اختلاف بسیار معنیداری بیشتر از جمعیت آن روی درختان سالم بود که میتواند نشان دهنده اثرگذاری جاروکها در جلب و تکثیر حشره ناقل و امکان کنترل حشره ناقل و متعاقب آن بیماری جاروک از طریق حذف جاروکها باشد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27319_1a924af6173c4a43517200ad8a99eea6.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622Molecular Identification and Detection of Phytophthora melonis Based on Nuclear and Cytoplasmic Genomeشناسایی و ردیابی مولکولی Phytophthora melonis براساس ژنوم هستهای و میتوکندریایی*9711727320FAسیده معصومه ذوالانواریدانشآموخته کارشناسی ارشدرضا مستوفیزاده قلمفرسااستاد بیماری شناسی گیاهی و دانشیار اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز0000-0001-5572-918Xعلی دادخداییدانش آموخته کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی دانشگاه شیرازJournal Article20170412The plant pathogen <em>Phytophthora melonis</em> is morphologically similar to some other non-papillate <em>Phytophthora</em> spp. especially <em>P. drechsleri</em> and therefore it is difficult to discriminate these convergent taxa. This study was performed to design specific primers based on nuclear and cytoplasmic genome, examine their specificity against other convergent species, and optimize the specific primers’ conditions to detect <em>P. melonis</em>. Nine nuclear and four cytoplasmic genes were appropriate to design thirteen specific primers based on their nucleotide polymorphism. PCR conditions were optimized. <em>Phytophthora melonis </em>were detected by specific primers in inoculated plants such as cucumber, watermelon, melon, sugar beet and pistachio. All specific primers detected pathogen in 1:100 (pathogen: soil) inoculated soil.Up to 10 zoospores per milliliter were detected using nested polymerase chain reaction. ITS-MF1 and ITS-MR2 (ITS-M2 set, from internal transcribed spacers of rRNA gene) were selected as the most efficient primers based on their specificity and sensitivity. The optimized annealing temperature for this primer set was 68 °C. It seemed that nested PCR by ITS-M2 primer set together withthe universal primers ITS6 and ITS4 as external primers is at least 10<sup>6</sup> times more sensitive than simple PCR. Multiplex polymerase chain reaction simultaneously detected the three cucurbits’ pathogens including <em>P. melonis, P. nicotianae</em> and <em>P. drechsleri.</em> This study showed that the designed primers could be effective tools for detection of <em>P. melonis</em> isolates from infected tissues, and infested water and soil.گونهی بیمارگر گیاهی <em>Phytophthora melonis</em> از نظر ریختشناختی به برخی گونههای بدون پستانک جنس <em>Phytophthora</em> بهخصوص <em>P. drechsleri</em> شباهت دارد وبنابراین تفکیک این آرایههای همگرا دشوار است. این پژوهش به منظور طراحی آغازگرهای اختصاصی <em>P. melonis</em> بر اساس ژنوم هستهای و میتوکندریایی، بررسی اختصاصیت آنها در برابر سایر گونههای همگرا، و بهینهسازی استفاده از این آغازگرها برای ردیابی <em>P. melonis</em> انجام شد. برای طراحی آغازگرهای اختصاصی گونهی <em>P. melonis</em> نُه ژن هستهای و چهار ژن میتوکندریایی از نظر تفاوت نوکلئوتیدی مناسب بودند، بنابراین سیزده آغازگر اختصاصی طراحی و خصوصیات آنها بهینهسازی گردید. ردیابی <em>P. melonis</em> با استفاده از پنج جفت از آغازگرهای اختصاصی در بافت مایهزنی شدهی گیاهان میزبان آن شامل خیار، خربزه، هندوانه، چغندرقند و پسته انجام شد. با استفاده از آغازگرهای طراحی شده در واکنش زنجیرهای پلیمراز تودرتو، تا سطح یک درصد مایهی بیماریزا در خاک آلوده و زئوسپورهای بیمارگر تا غلظت10 زئوسپور در میلیلیتر در آب آلوده ردیابی شدند. با بررسی اختصاصیت و حساسیت آغازگرهای طراحی شده، کارامدترین آنها مجموعهی ITS-M2 (ترکیب آغازگرهای ITS-MF1 و ITS-MR2) در نظر گرفته شد. دمای همجوشی بهینهسازی شده برای این مجموعه 68 درجهی سلسیوس بود. به نظر میرسد استفاده از واکنش زنجیرهای پلیمراز تودرتو با استفاده از مجموعهی ITS-M2 به همراه آغازگرهای عمومی ITS4 و ITS6 در نقش آغازگرهای خارجی در حدود 10<sup>6 </sup>برابر حساستر از واکنش زنجیرهای پلیمراز مستقیم است. آزمون زنجیرهای پلیمراز چندگانهی طراحی شده، قادر به ردیابی همزمان سه گونهی بیمارگر شامل <em>P. melonis</em>، <em>P. drechsleri</em> و <em>P. nicotianae</em> بود.آزمایشها نشان داد که آغازگرهای طراحی شده ابزاری کارآمدی برای ردیابی <em>P. melonis</em> در بافت گیاه، خاک و آب آلوده هستند.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27320_365f032c2347fad3fc89f538a7d734fe.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622First report of virulence to resistance gene Sr25 by the stem rust pathogen (Puccinia graminis f. sp. tritici) in Ardabil, North West of Iranاولین گزارش از بیماریزائی زنگ ساقه گندم (Puccinia graminis f. sp. tritici) بر روی ژن Sr25 در اردبیل٬ شمالغرب ایران11912227321FAصفرعلی صفویبخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان اردبیل، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، اردبیل، ایرانفرزاد افشاریاستاد پژوهشی، مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایرانJournal Article20160907<strong> </strong> <br /> <br /> <br />Stem (black) rust, caused by <em>Puccinia graminis</em> Pers. f. sp. <em>tritici</em> Erikss. & Henning, is one of the most destructive diseases of wheat around the world. It could be controlled through deployment of race-specific resistance genes (Jain <em>et al</em>. 2009). However, such kind of resistance is mostly short lived due to emergence of new virulences. For example, due to emergence of Ug99 resistance genes <em>Sr5,Sr6, Sr7a, Sr7b, Sr8a, Sr8b</em>, <em>Sr9a, Sr9b, Sr9d, Sr9e, Sr9f, Sr9g, Sr9h, Sr10, Sr11, Sr12</em>, <em>Sr16, Sr17</em>, <em>Sr18, Sr19, Sr20, Sr21, Sr23</em>, <em>Sr24, Sr30, Sr31, Sr34, Sr36, Sr38, Sr41, Sr49, Sr54, SrMcN</em>, <em>SrWld-1</em> are no longer effective (Singh <em>et al</em>. 2015) and cannot be used in breeding programs. Monitoring of new virulence factors has remained very important in the evaluation and identification of new sources of resistance. Considering to the importance of stem rust especially the race of Ug99 (also named TTKSK), during cropping season of 2015-2016, virulence of the wheat stem rust was investigated by planting 47 isogenic lines (in national trap nursery) under field conditions. This survey was conducted in Ardabi Agricultural Research Station (38.17°N, 48.39°E, 1350 m Height), North West of Iran. Each entry was planted in two 1 meter rows which were spaced 30cm apart. Plots were spaced at 65 cm. A susceptible spreader (Morocco) row was sown around the borders of the experiment and 10 entry intervals.All the required cultural practices were carried out during the experiment. Disease severity was estimated according to the modified Cobb,s scale; 0% = immune, and 100% = fully susceptible when disease was well-developed (Peterson <em>et al.</em> 1948). The infection type (IT) of disease was also recorded based on Roelfs <em>et al</em>. (1992). The presence of virulence factors was determined by susceptible infection type while monitoring the disease on differential sets. In other words, corresponding genes against virulence factors of pathogen in plants were considered as ineffective genes and corresponding genes against avirulence factors of pathogen were considered as effective resistance genes. Results showed that there is virulence to resistance gene <em>Sr25</em>, a gene from <em>Thinopyrum elongatum</em>, which is located on chromosome 7DL and linked with leaf rust resistance gene <em>Lr19</em>. The resistance <em>Sr25</em> had been effective or partially effective against stem rust worldwide, including race Ug99 (Singh <em>et al. </em>2011). The detection of <em>Sr25</em> virulence is significant since <em>Sr25</em> is an important gene to be targeted for breeding wheat cultivars resistant to Ug99. In this research, ineffectiveness of <em>Sr25</em> was observed in first time in Ardabil (Northwest of Iran), and thus we should not use this resistance gene in breeding program (at least in Ardabil). Before of this report, viulence to <em>Sr25</em> had also been reported in India (Jain <em>et al</em>. 2009). Considering to rapid spread of Ug99 and its threat in some parts of Iran (Nazari <em>et al. </em>2009), and in order to obtain of durable resistance, adult plant resistance (APR) or slow rusting genes such as <em>Sr2, Sr55, Sr56, Sr57 </em>and<em> Sr58</em> should be deployed in combination with each other or with effective seedling (all-stage) resistance genes; <em>Sr22, Sr26, Sr33, Sr35, Sr45</em> and <em>Sr50</em>. <br /> <br /> <br /> زنگ ساقه یا سیاه گندم، با عامل <em>Puccinia graminis</em> Pers. f. sp. <em>tritici</em> Erikss. & Henning، یکی از مخربترین بیماریهای گندم در سراسر جهان به شمار میرود. این بیماری با به بکارگیری ژنهای مقاومت اختصاص- نژادی کنترل میشد، اما این نوع مقاومت پایدار نبوده و با ظهور نژادهای جدید عامل بیماری کارائی خود را از دست میداد (Jain <em>et al</em>. 2009). به عنوان مثال، با ظهور نژادUg99 ژنهای مقاومت <em>Sr5 </em><em>٬</em><em>Sr6</em><em>٬</em><em>Sr7a </em><em>٬</em><em>Sr8a </em><em>٬</em><em>Sr8b</em><em>٬</em><em>Sr9a </em><em>٬</em><em>Sr9b </em><em>٬</em><em>Sr9f</em><em>٬</em><em>Sr9h </em><em>٬</em><em>Sr10</em><em>٬</em><em>Sr16</em><em>٬</em><em>Sr18 </em><em>٬</em><em>Sr19</em><em>٬</em><em>Sr20 </em><em>٬</em><em>Sr23 </em><em>٬</em><em>Sr24</em><em>٬</em><em>Sr30 </em><em>٬</em><em>Sr31 </em><em>٬</em><em>Sr34</em><em>٬</em><em>Sr36</em><em>٬</em><em>Sr38 </em><em>٬</em><em>Sr41</em><em>٬</em><em>Sr49</em><em>٬</em><em>Sr54 </em><em>٬</em><em>SrMcN</em><em>٬</em><em>SrWld-1 </em><em>٬</em><em>Sr9d </em><em>٬</em><em>Sr9e</em><em>٬</em><em>Sr9g </em><em>٬</em><em>Sr11</em><em>٬</em><em>Sr12</em><em>٬</em><em>Sr17 </em> و <em>S21</em> دیگر موثر نبوده و نمیتوان از آنها در برنامههای به نژادی استفاده کرد (Singh<em> et al</em>. 2015). ردیابی فاکتورهای بیماریزائی جدید در ارزیابی و تشخیص منابع جدید مقاومت بسیار مهم و حیاتی هستند. با توجه به اهمیت بیماری زنگ ساقه و به ویژه نژاد Ug99، در فصل زراعی 95-1394 برای تعیین کارائی ژنهای مقاومت به زنگ ساقه پروژهای با کاشت لاینهای ایزوژنیک در خزانه تله تحت شرایط مزرعهای اجرا و مطالعه شد. این بررسی در ایستگاه تحقیقات کشاورزی اردبیل (با مشخصات جغرافیایی: عرض شمالی 38 درجه و 17 دقیقه، طول شرقی 48 درجه و 39 دقیقه، ارتفاع از سطح دریا 1350 متر) انجام شد. هر ژنوتیپ در ردیف های یک متری با دو خط به فاصله 30 سانتی متر کاشته شدند فاصله پشته ها نیز 65 سانتی متر در نظر گرفته شد رقم حساس (موروکو) در اطراف خزانه وحد فاصل ارقام به فاصله هر ده رقم کاشته شد. تمام عملیات زراعی مورد نیاز در طی سال اجرای پژوهش انجام شدند. شدت بیماری بر اساس روش اصلاح شده کب از صفر تا 100 درصد انجام شد (Peterson <em>et al.</em> 1948). زمانی که بیماری روی برگ پرچم پیشرفت کرد تیپ آلودگی (IT) براساس روش رولفز و همکاران (Roelfs <em>et al</em>. 1992) یادداشت برداری شد. وجود فاکتورهای بیماریزایی با مقایسه تیپ آلودگی رقم حساس ضمن پایش بیماری روی ارقام افتراقی تعیین شد. به عبارت دیگر ژنهایی مقابل فاکتورهای بیماریزایی بیمارگر در گیاهان به عنوان ژنهای غیر موثر در نظر گرفته شدند که<br /> <br /> شکل 1 – علائم زنگ ساقه گندم روی لاین گندم LC SR25 ARS (حاوی ژن مقاومت <em>Sr25</em>) در ایستگاه اردبیل – سال 1395<br /> Figure 1. Symptoms of stem rust on wheat line LC SR25 ARS (having resistance gene <em>Sr25</em>) in Ardabil, 2016<br /> <br /> بیماریزایی روی آنها وجود داشت و تیپ آلودگی MSS یا S بود و ژنهای مسئول مقاومت در گیاه در برابر فاکتورهای غیر بیماریزایی (<em>Avr</em>-genes) به عنوان ژنهای مقاومت موثر در نظر گرفته شدند. نتایج این بررسی بیانگر وجود بیماریزائی در جمعیت نژادی مستقر در اردبیل روی ژن<em> Sr25 </em>(لاین LC SR25 ARS) بود. این ژن با ژن مقاومت <em>Lr19</em> (ژن مقاوم به زنگ قهوهای) روی کروموزوم 7DL با یکدیگر پیوستگی داشته و از <em>Thinopyrum elongatum</em> به گندم منتقل شده است (Singh <em>et al. </em>2011). این ژن نسبت به زنگ سیاه گندم (و نژاد Ug99) در سراسر جهان موثر یا نسبتاً موثر بوده است (Singh <em>et al. 20</em>11). ظهور بیماریزائی روی ژن <em>Sr25</em> مهم است، زیرا این ژن به دلیل مقاومت در برابر گروه نژادی Ug99 در برنامههای به نژادی مورد هدف بود. در این بررسی عدم کارائی <em>Sr25</em> در برابر نژادهای محلی زنگ ساقه نشان داده شد و در ایران برای اولین بار از اردبیل گزارش میشود. بیماریزائی برای ژن یادشده قبلاً از هندوستان نیز گزارش شده بود. با توجه به عدم کارائی این ژن بایستی در برنامه های به نژادی از بکار گیری آن (حداقل در اردبیل) خودداری گردد. برای رسیدن به مقاومت پایدار و با درنظر گرفتن خطر شیوع نژاد Ug99 در قسمت های مختلف ایران (Nazari <em>et al.</em> 2009) بایستی ژنهای مقاومت گیاه کامل مانند<em>Sr2 ٬ Sr55٬Sr56 ٬Sr57 ٬ Sr58</em> در ترکیب با یکدیگر و یا با ژنهای مقاومت گیاهچهای (اختصاص-نژادی) موثر مانند <em>Sr22٬Sr26 ٬Sr33 ٬ Sr35٬Sr45</em>٬ و<em>Sr50 </em>بکار گرفته شوندhttps://ijpp.areeo.ac.ir/article_27321_c6a67b46a9e4c0f9897ddc226745acaf.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277453120170622First record of Ogma floridensis (Nematoda: Criconematidae) from Iranاولین گزارش از نماتود Ogma floridensis (Nematoda: Criconematidae) در ایران12312727322FAمحسن عسگریبه ترتیب دانشجوی کارشناسی ارشد ، دانشگاه زنجانعلی اسکندریعضو هیئت علمی/گروه گیاهپزشکی-دانشکده کشاورزی-دانشگاه زنجان0000-0003-3902-7422Journal Article20170219<strong> </strong> <br /> <br /> <br />The genus <em>Ogma</em> Southern 1914 belongs to the family Criconematidae Taylor, 1936, that can be differentiated from other genera of the family by its offset head annuli, vulva closed and presence of 6-26 longitudinal rows of appendages of various shape on cuticular annuli of both females and juveniles. In ongoing faunistic studies on plant parasitic nematodes of Zanjan province, one known <em>Ogma</em> species was recovered from rhizosphere of poplar tree in Shilandar village, Zanjan province and was identified as <em>Ogma floridensis</em> Vovlas, Inserra & Esser, 1991. This species is reported from Iran for the first time and described here.جنس <em>Ogma </em>Southern, 1914 متعلق به خانواده Criconematidae Taylor, 1936 است که به دلیل تمایز حلقههای سر نسبت به سایر حلقههای بدن، شکاف تناسلی بسته و وجود 6-26 ردیف از تزئینات خار یا فلس مانند در سطح کوتیکول بدن افراد ماده و جوان، از سایر جنسهای این خانواده متمایز میگردد. تاکنون دو گونه متعلق به این جنس، شامل<br /> <em>O. murrayi</em> Southern, 1914 توسط اشرفی و همکاران (Ashrafi <em>et al.</em> 2012) و <em>O. fagini</em> Escuer & Bello, 1996 توسط نیاستی و همکاران (Niasti <em>et al.</em> 2016) از ایران گزارش شده است. در مطالعات فونستیک مرتبط با شناسایی نماتودهای انگل گیاهی استان زنجان، گونهی دیگری از این جنس با نام <em>O. floridensis</em> Vovlas, Inserra & Esser, 1991 از خاک اطراف ریشه صنوبر در روستای شیلاندر، جداسازی و شناسایی گردید که برای فون نماتودهای ایران جدید است. مشخصات این گونه شامل:<br /> <strong>مادهها.</strong> سر دارای دو حلقه متمایز از سایر حلقههای بدن، حلقه اول سر متمایل به جلو، دارای حاشیه نامنظم، به عرض 17(15-19) و حلقه دوم آن متمایل به جلو یا طرفین بدن، دارای حاشیه صاف، به عرض 15 (14-17) میکرومتر؛ سر از دید روبرو دارای چهار برجستگی مجاور میانی (submedian lobes)؛ عرض حلقه اول بدن 23 (21-25) و عرض حلقه دوم آن 28 (25-30) میکرومتر؛ استایلت بلند و باریک و در بعضی نمونهها خمیده، دارای گرههای لنگر مانند (anchor-shape)، متوسط طول حلقههای بدن 7/7 میکرومتر، حلقههای بدن متمایل به سمت عقب و دارای 10 تا 11 ردیف از فلسهای زبانی شکل ساده یا دو قسمتی و به ندرت سه قسمتی؛ لوله تناسلی مستقیم، حاوی اسپرم، شکاف تناسلی بسته. دم نسبتاً بلند و مخروطی، دو یا سه حلقه آخر دم بدون تزئینات یا دارای حاشیه نامنظم و حلقه آخر آن ساده و یک قسمتی است (شکل 1).<br /> <strong>نرها.</strong> دارای ناحیه لبی گرد به عرض 11-13 و ارتفاع 5-7 میکرومتر؛ فاقد استایلت و مری؛ متوسط طول حلقههای بدن چهار میکرومتر، بورسا کوچک، هیپوپتیگما مشخص، اسپیکول به طول 38-41 میکرومتر و خمیده، گوبرناکولوم اندکی خمیده به طول 7-8 میکرومتر است (شکل 1).https://ijpp.areeo.ac.ir/article_27322_03ce0bcae9ee7e3eeb25bd511cd603bf.pdf