انجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277458120220823Isolation and Detection of Atoxigenic Isolates of Aspergillus flavus and A. parasiticus from Peanut Fields in Astaneh Ashrafieh (Guilan Province)with emphasize on developing Aflatoxin Contamination Risk Mapجداسازی و شناسایی جدایههای غیرتوکسینزای Aspergillus flavus وA. parasiticus از مزارع بادامزمینی آستانه اشرفیه (استان گیلان)با تاکید بر تهیه نقشه خطر آلودگی آفلاتوکسین11825512810.22034/ijpp.2022.535268.367FAرقیه زیارتیدانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایرانحبیب اله حمزه زرقانیدانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران0000-0001-9046-6426محمد مرادیعضوء هیات علمی موسسه تحقیقات پسته کشورJournal Article20210910Aflatoxins are toxic secondary metabolites produced by speices of Aspergillus including A. flavus and A. parasiticus. Mycotoxins are potential carcinogens and reduce global trade of agricultural products. Soil and peanuts were sampled across fields located in seven important peanut production villages of Astaneh Ashrafieh to investigate the frequency of toxigenic and atoxigenic strains of A. flavus and A. parasiticus. Toxigenicity of the Flavi section strains was evaluated according to change in color of the back of colonies on coconut agar in contact with ammonium hydroxide vapor. 48 isolates of Flavi section were identified, including 20 isolates of A. flavus and 28 isolates of A. parasiticus with nine atoxigenic and 39 toxigenic isolates. Risk maps were developed based on mean toxigenicity where Lakujdeh, Mohsenabad, and Noghredeh respectively with mean toxigenicity of 2.50, 2.25 and 2.10 had the highest risk scores for peanut cultivation while parkaposht, Nubijarmahale and Nabi dehka with mean toxigenicity of 1.00, had the lowest risk scores. Peanut fields located in Dehsar with a mean toxigenicity of 1.50 were classified with moderate risk scores. The outlook of this study was based on identification of atoxigenic isolates of the fungus with potential future application in biological control of toxigenic strains of Flavi section and emphasize on their competitive ability to colonize peanuts as well as developing risk maps to plan for reducing the risk of aflatoxin production on peanuts, an important product of Guilan province, and to pave the way for increased production and export of this product.آفلاتوکسینها متابولیتهای ثانویه سمی میباشند که توسط گونههای Aspergillus مانند A. flavus و A. parasiticus تولید میشوند. این زهرابههای قارچی سرطانزا هستند و موجب کاهش تجارت جهانی بسیاری از محصولات کشاورزی میگردند. در این تحقیق فراوانی جدایههای توکسینزا و غیرتوکسینزای این دو گونه از خاک و بادام زمینی هفت روستای مهم تولید بادام زمینی در آستانه اشرفیه بررسی شد. توانایی توکسینزایی جدایهها، با بررسی تغییر رنگ پشت پرگنهها در معرض بخار آمونیوم هیدروکسید روی محیط کشت نارگیل-آگار انجام شد. 48 جدایه از بخش Flavi شناسائی شد که شامل 20 جدایه از گونه A. flavus و 28 جدایه از گونه A. parasiticus میباشد که 9 جدایه غیرتوکسینزا و 39 جدایه توکسینزا بودند. نقشه خطر توکسینزایی هر روستا ترسیم شد که نشان داد روستاهای لاکوژده، محسنآباد و نقره ده به ترتیب با میانگین توکسینزایی 5/2، 25/2 و 1/2 پرخطرترین روستاهای کشت بادام زمینی و روستاهای پرکاپشت، نوبیجار محله و نبی دهکا با میانگین توکسینزایی 1 کمخطرترین روستاهای آستانه اشرفیه محسوب میشوند. همچنین روستای دهسر با میانگین توکسینزایی 5/1 در میانه این تقسیمبندی قرار میگیرد. دورنمای این پژوهش مبتنی بر تشخیص جدایههای غیرتوکسینزای بومی آستانه اشرفیه به منظور استفاده در مهار زیستی ازنظر بٌعد رقابتی آن و تهیه اطلس خطر بود تا بتوان خطر تولید آفلاتوکسین در بادام زمینی، این محصول پراهمیت استان گیلان را کاهش داد و راه را برای افزایش تولید و صادرات این محصول هموارتر کرد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_255128_1967f351cd727daf0815cc247f17c3c3.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277458120220823Nucleotide sequence and genetic analysis of the small RNAs of two Iranian isolates of Iris yellow spot virus (IYSV) from leek and onionتوالی نوکلئوتیدی و تجزیه ژنتیکی قطعه کوچک ژنومی دو جدایه ایرانی ویروس لکه زرد زنبق(IYSV) از تره و پیاز193425513010.22034/ijpp.2022.554345.387FAحسین بیاتعضو هیات علمی پژوهشکده گل و گیاهان زینتی/ رییس0000-0002-8771-780Xافشین حسنی مهربانعضو هیات علمی، تهران، بلوار کشاورز، بین کارگر و جمالزاده، پلاک 346 ، طبقه 5 واحد 19 ، شرکت بازرسی تاکناصر صفاییگروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرسمسعود شمس بخشدانشگاه تربیت مدرس0000-0002-4336-7705Journal Article20220523Iris yellow spot virus (IYSV) is a member of the Eurasian phylogenetic group of the genus Orthotospovirus. Similar to other species in the genus, the viral particles contain three genomic fragments: small (S), medium (M), and large (L) RNAs. In the present study, the complete nucleotide sequence of the small fragment (S) RNA of two IYSV isolates from leek (Allium ampeloprasum ) (IYSV-Le1M) and onion (A. cepa) (IYSV-O2K) and the non-structural gene of the M RNA of the IYSV-Le1M isolate were determined. The results showed that based on nucleocapsid (N), small (NSs), and medium (NSm) RNA fragment non-structural genes, the isolates of Markazi Province are more closely related to each other than other IYSV isolates. However, the intergenic region (IGR) of the two isolates showed significant structural differences compared to other sequenced IYSV isolates. The IGR of the IYSV-Le1M isolate was longer than those of other IYSV isolates studied, while, for IYSV-O2K isolate, it was 440 nucleotides shorter. It was also found that for Indian and Dutch IYSV isolates, the IGR was 31 and 22 nucleotides shorter than that in the IYSV-Le1M isolate. These findings provide new information about the genetic diversity and phylogeny of IYSV isolates.ویروس لکه زرد زنبق (Iris yellow spot virus, IYSV) یکی از گونههای گروه تبارزائی یوراسیایی جنس Orthotospovirus است که مشابه سایر گونههای این جنس، از نظر ژنومی دارای سه قطعه ژنومی کوچک (S) ، متوسط (M) و بزرگ (L) است. در مطالعه حاضر توالی کامل قطعه کوچک دو جدایه ویروس از میزبان تره ایرانی (Allium ampeloprasum) (IYSV-Le1M) و پیاز (A. cepa) (IYSV-O2K) و نیز ژن غیر ساختمانی قطعه متوسط (M) جدایه IYSV-Le1M تعیین شد. نتایج نشان داد که بر اساس توالی آمینواسیدی ژنهای نوکلئوکپسید (N)، غیر ساختمانی قطعه کوچک (NSs) و غیر ساختمانی قطعه متوسط (NSm)، جدایههای استان مرکزی نسبت به سایر جدایههای ویروس لکه زرد زنبق بیشترین قرابت را با یکدیگر دارند. با این حال منطقه بین ژنی (Intergenic Region, IGR) قطعه آر ان ای کوچک این دو جدایه با سایر جدایههای تعیین توالی شده ویروس لکه زرد زنبق تفاوتهای ساختمانی مشخصی را نشان داد. منطقه بین ژنی جدایه تره ایرانی دارای بیشترین طول در بین جدایه های ویروس لکه زرد زنبق تعیین توالی شده بود، این ناحیه در جدایه پیاز 440 نوکلئوتید و در جدایههای هندی و هلندی به ترتیب 31 و 22 نوکلئوتید نسبت به جدایه تره ایرانی کوتاهتر بودند. یافتههای بررسی حاضر اطلاعات جدیدی در خصوص تنوع ژنتیکی و تبارزایی جدایه های ویروس لکه زرد زنبق ارایه میدهد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_255130_04ac6134360c31515f8c5d1d4ce1992b.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277458120220823Phylogenetic position of Hamedan isolates of barley yellow dwarf virus using polymerase gene sequence: first report of BYDV-PAS species in Iranموقعیت فیلوژنتیکی جدایههای همدان ویروس کوتولگی زرد جو با استفاده از ترادف ژن پلیمراز: اولین گزارش گونه BYDV-PAS در ایران354270147210.22034/ijpp.2023.562065.393FAآرزو پاکدلگروه گیاهپزشکی- دانشکده کشاورزی- دانشگاه بوعلی سینا- همدان- ایراننگار رداییگروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایرانJournal Article20220918Barley yellow dwarf virus (BYDV) causes a significant yield reduction and crop loss in cereal and grasses worldwide. Studies revealed that barley yellow dwarf virus is present in most regions of Iran. Wheat and barley plants showing the infection symptoms were collected from cereal fields in Hamedan Province during the springs of 2020 and 2021. Samples were tested for BYDV infection by Indirect ELISA. Positive reactions to BYDV antibody in most samples were detected. After total RNA extraction, RT-PCR was performed to amplify polymerase gene using specific BYDV-PAV primers. BYDV-PAV is the most prevalent species of BYDVs in Iran. Results confirmed BYDV infection. For molecular and phylogenetic comparison, two samples from Hamedan and Asadabad were selected and their polymerase genes were sequenced. The sequencing results revealed that Hamedan isolate had maximum homology with Kahnouj, Karaj, Yazd and Arak isolates (with 95% - 96% identity). The isolates in this group proposed as a distinct species due to their low similarity with other isolates in GenBank. Asadabad isolate had maximum homology with Estonia and America BYDV-PAS with more than 92% homology. The results of phylogenetic analysis revealed that Iranian isolates of BYDV clustered in three distinct groups which shows the presence of a high diversity in the polymerase gene of this virus. This study is the first report of BYDV-PAS species in Iran.ویروس کوتولگی زرد جو (barley yellow dwarf virus, BYDV)به طور قابل توجهی باعث کاهش محصول غلات و سایرگیاهان خانواده گندمیان در سراسر جهان میشود. مطالعات انجام شده نشان میدهد که این ویروس در اکثر نقاط ایران پراکنش دارد. در بهار سالهای ۱۳۹۹ و ۱۴۰۰ نمونههای گیاهی دارای علائم بیماری، از مزارع گندم و جو شهرستانهای استان همدان جمعآوری شدند. آزمون الایزای غیرمستقیم با استفاده از آنتیبادی اختصاصی BYDV انجام شد و نتایج نشان داد که درصد بالایی از نمونههای جمعآوری شده به BYDV آلوده بودند. پس از استخراج آرانای کل، آزمون RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی BYDV-PAV که سویه رایج این ویروس در اکثر مناطق کشور میباشد، انجام شد. نتایج آزمون RT-PCR، آلودگی به BYDV را تایید نمود. به منظور مقایسه مولکولی ژن پلیمراز و تبارزایی بر اساس این ژن، دو جدایه از شهرستانهای اسدآباد و همدان انتخاب و ژن پلیمراز آنها تعیین ترادف شدند. مقایسه توالیهای حاصل نشان داد که جدایه همدان بیشترین شباهت را با جدایههای کهنوج، کرج، یزد و اراک دارد (با شباهت حدود ۹۵% تا ۹۶%). جدایههای مذکور به دلیل شباهت کم با سایر جدایههای موجود در بانک ژن به عنوان یک گونه مجزا پیشنهاد شدند. جدایه اسدآباد بیشترین شباهت را با BYDV-PAS آمریکا و استونی داشت (با بیش از ۹۲% شباهت). نتایج حاصل از تبارزائی نشان داد که جدایههای ایرانی BYDV براساس ژن پلیمراز در سه گروه مجزا قرار گرفتند که نشان دهنده وجود تنوع بالا در ژن پلیمراز این ویروس است. تحقیق حاضر اولین گزارش از ردیابی گونه BYDV-PAS در ایران میباشد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_701472_418fd5a3320d041de6c81b053118cdd9.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277458120220823Effect of vermicompost application on the movement of second stage juveniles of the root-knot nematode Meloidogyne incognita in soilتاثیر کاربرد ورمیکمپوست بر حرکت لارو سن دو نماتد ریشه گرهی (Meloidogyne incognita) در خاک434970098810.22034/ijpp.2022.1974225.394FAپریسا ظهرابیگروه علوم خاک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی ‏سینا، همدان، ایرانزهرا کلاهچیگروه علوم خاک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی‏ سینا، همدان، ایرانلیلا کاشیدانشگاه بوعلی سینا، گروه گیاه پزشکیمحبوبه ضرابیگروه علوم خاک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ملایر، ملایر، ایرانJournal Article20221125The movement of plant-parasitic nematodes in soil is influenced by the soil environment and the microorganisms present in it, and soil conditions affect disease incident. The objective of this study was to investigate the movement of second-stage juveniles of the root-knot nematode Meloidogyne incognita 18 weeks after incubation with vermicompost, under constant saturation flow 24 and 72 hours after addition of the nematodes. The test was conducted as a factorial experiment with a randomized complete block design in three replicates. The nematodes were extracted by the tray method and then counted. The results showed that 24 hours after nematode injection into the control soil, the highest population of nematodes was observed at the injection site and the nematodes moved more toward the water flow. At 72 hours after injection, a higher percentage of them moved and the nematode population decreased at the injection site (1.52%). Also, in the soil treated with vermicompost for 18 weeks, nematodes moved both in and against the direction of water flow 24 hours after injection and were distributed in all points of the column. The highest rate of nematode movement was observed at point (-4) at 14%. At 72 hours after injection, the nematodes were also very evenly distributed throughout the column and the number of nematodes that entered the wastewater was higher.حرکت نماتدهای انگل گیاهی در خاک، تحت تأثیر محیط و ریزموجودات درون آن است و شرایط خاک در شروع بیماری مؤثر است. این مطالعه با هدف بررسی حرکت لارو سن دو نماتد ریشهگرهی Meloidogyne incognita، 18 هفته پس از انکوباسیون با ورمیکمپوست، تحت جریان اشباع ماندگار، 24 و 72 ساعت پس از افزودن نماتد انجام شد. آزمون به صورت فاکتوریل و در قالب طرح کاملا تصادفی تصادفی در سه تکرار انجام شد. نماتدها به روش سینی استخراج و شمارش شدند. نتایج نشان داد 24 ساعت پس از تزریق نماتد در خاک شاهد، بیشترین جمعیت نماتدها در نقطه تزریق مشاهده شد و نماتدها بیشتر در جهت جریان آب حرکت کردند. درحالیکه 72 ساعت پس از تزریق، درصد بیشتری از آنها حرکت کرده و جمعیت نماتد در نقطه تزریق کاهش یافت (52/1 درصد) کاهش یافت. همچنین در خاک تیمار شده با ورمیکمپوست به مدت 18 هفته، 24 ساعت پس از تزریق، نماتدها هم در جهت و هم در خلاف جهت جریان آب حرکت کرده و در تمام نقاط ستون پراکنده شدند. بیشترین میزان حرکت نماتدها 14% در نقطه 4- دیده شد. همچنین، 72 ساعت پس از تزریق، نماتدها به طور بسیار یکنواخت در تمام ستون پراکنده شده و تعداد نماتدهایی که وارد زهاب شدند بیشتر بود.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_700988_18eba56d0c93452d8f170656d4e40936.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277458120220823Report of alfalfa crown wart disease caused by Physoderma alfalfae from Kermanshah provinceگزارش بیماری گال طوقه یونجه با عامل Physoderma alfalfae از استان کرمانشاه515325396110.22034/ijpp.2022.555871.389FAM.Sheikholeslami F.Noori H.Younesi D.Safaeeعضو هیأت علمی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان کرمانشاه0000-0003-2009-9514داریوش صفاییعضو هیات علمی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی کرمانشاهJournal Article20220621During visiting the alfalfa fields in Sahneh county of Kermanshah province, the symptoms of a disease were observed in the form of galls with variable sizes in the crown part of the plants, which had caused a severe decrease in the growth in the alfalfa fields. The size of the galls varied from a few millimeters to several centimeters and were observed only in the crown. After transfer to the laboratory and microscopic examinations, a species of fungus with the characteristics of Physoderma alfalfae (Pat & Lagerh.) Karling Syn: Urophlyctis alfalfae (Pat & Lagerh.) Magnus was observed with chambers containing numerous resting spores and turbinate cells (Figure 1), which are prominent features of alfalfa crown wart disease cause. The resting spores had a depressed part and their size was 40-55 micrometers in the longer diameter and 22.5-35 micrometers in the shorter diameter. According to the classification of Hibett et al. (2007), this species is placed in the Blastocladiomycota phylum, Blastocladiomycetes order and Blastocladiales order. The fungus was first reported by Viennot-Bourgin et al. in 1970 from Karaj on alfalfa plant, but afterward there has been no other report of the disease or the fungus in Iran. Considering the damage caused by this disease, it is important to pay attention to its monitoring and to study its biological and pathogenic aspects.در بررسی مزارع یونجه شهرستان صحنه استان کرمانشاه علایم نوعی بیماری به صورت گال هایی با اندازه های متغیر در قسمت طوقه بوته ها مشاهده گردید که سبب کاهش رشد شدید در مزارع شده بود. اندازه گال ها از چند میلی متر تا چند سانتی متر متغیر بود و تنها در قسمت طوقه مشاهده گردید. پس از انتقال به آزمایشگاه و بررسیهای میکروسکوپی گونه ای قارچ با مشخصات قارچ <br /><br />Syn: Urophlyctis alfalfae (Pat & Lagerh.) Physoderma alfalfae (Pat & Lagerh.) Karling , با داشتن محفظه های حاوی اسپورهای استراحتی فراوان و اندام های فرفره ای که از ویژگی های بارز عامل بیماری گال طوقه یونجه است مشاهده گردید (شکل 1). اسپورهای استراحتی دارای یک قسمت فرورفته و اندازه آنها در قطر بزرگتر 55-40 میکرومتر و در قطر کوچک تر 35-5/22 میکرومتر بود. بر اساس رده بندی هیبت و همکاران(2007) این گونه در شاخه بلاستوکلادیومیکوتا، رده بلاستوکلادیومیست و راسته بلاستوکلادیال قرار می گیرد (Hibett et al., 2007). قارچ عامل بیماری اولین بار توسط وینوبورژن و همکاران در سال 1970 از کرج و بر روی یونجه گزارش شده است (Viennot-Bourgin et al., 1970) اما پس از آن گزارش دیگری از وجود این قارچ در ایران به ثبت نرسیده است. با توجه به خسارت بالای بیماری در مزارعی که مورد نمونهبرداری قرار گرفت، پایش بیماری و مطالعهی جنبه های زیست شناسی و بیماری زایی آن اهمیت دارد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_253961_fee0ec1447ea7833d305b7fb9c360bec.pdfانجمن بیماری شناسی گیاهی ایرانبیماریهای گیاهی0006-277458120220823The First Report of Tomato torrado virus (ToTV) occurrence in Iranاولین گزارش از وقوع ویروس تورادو گوجهفرنگی از ایران555969704010.22034/ijpp.2022.557747.390FAمهرداد صالح زادهدانشجوی دکتری بیماری شناسی گیاهی دانشگاه شیراز0000-0003-2048-9061علیرضا افشاریفربخش گیاهپزشکی، مرکز تحقیقات ویروس شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز0000-0002-9229-3001سعیده دهقانپور فراشاه2- استادیار بیماری شناسیگیاهی، دانشگاه پیام نور، تهران.Journal Article20220714Emerging plant diseases accounts for serious treats to agricultural crop yields, and food security. Tomato torrado virus (ToTV) for the first time was reported in canary island (Spain) from greenhouse-grown tomato plants expressing yellowing areas at the base of the leaflets which later turn into necrotic spots or large necrotic area covering leaves, stem and fruit (Verbeek et al., 2007). During a field survey carried out during spring 2021, a total number of 14 tomato plant samples showing severe necrosis symptoms on tomato leaves and fruits, similar to those described for ToTV (Moodley et al., 2019), were collected from an open tomato field in vicinity of Shiraz. , Total RNA was extracted from leaf and fruit tissues of 14 symptomatic samples using Trizol reagent, and for the presence of ToTV was subjected to reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) using a set of specific primer pair (3Avp/35seq R and 3Avp/35seq F) targeting approximately a 275 nucleotide fragment in the coat protein gene (Wieczoreck et al. 2020). Eleven symptomatic tomato samples yielded an amplicon of the expected size ( about 275 bp) in RT-PCR assay, Multiple alignment of the obtained nucleotide sequences showed that the Iranian ToTV isolates have the highest similarity of 98.2% (IRSHZ1) and 97.3% (IRSHZ3) with ToTV strain TEN-03 and the lowest similarity of 96.8% (IRSHZ1) and 95.4% (IRSHZ3) with ToTV strain GNC-06, both of which were reported from Spainآفات و بیماریهای نوظهور محصولات کشاورزی را در سراسر جهان تحتتاثیر قرار داده است. ویروس تورادو گوجهفرنگی (Tomato torrado virus, ToTV) برای اولینبار از بوتههای گوجهفرنگی گلخانهای با علائم بافتمردگی برگها، ساقه و میوه از جزیره قناری در اسپانیا گزارش شده است (Verbeek et al., 2007).طی بررسیهایی که در سال 1400 از مزارع گوجهفرنگی اطراف شیراز بعمل آمد، علائم بافتمردگی و در برخی موارد سوختگی شدید در برگها، ساقهها و میوههای گوجهفرنگی مشاهده شد. لکههای روی ساقه کشیده و لکههای نکروز روی میوه بعضا با هالهی زرد رنگ و علائمی شبیه به آفتابسوختگی و چروکیدگی روی میوه مطابق آنچه در مورد علائم ویروس تورادو توصیف شده است، (Moodley et al., 2019) مشاهده-شد. پس از استخراج آر ان ای کل از بافت برگ و میوه های دارای علائم (14 نمونه)، تلاش برای ردیابیToTV بهروش واکنش زنجیرهای پلیمراز با رونویسی معکوس (RT-PCR) با استفاده از یک جفت-آغازگر اختصاصی (3A/Vp35seq R و 3A/Vp35seq F) (Wieczoreck et al., 2020) منجربه تکثیر قطعهی 275 جفتبازی در 11 نمونه گردید. همردیفسازی چندگانه توالیهای حاصل از محصول PCR جدایههای ایرانی ToTV با ترادف ژن Vp35 مربوطبه 31 جدایهی ToTV موجود در ژنبانک نشان داد، جدایههای ایرانی بیشترین شباهت را بهترتیب 2/98 (IRSHZ1) و 97.3 درصد (IRSHZ3) را با ToTV استرین TEN-03 و کمترین شباهت 8/96 درصد (IRSHZ1) و 95.4 درصد (IRSHZ3)) را با ToTV استرینGNC-06 که هر دو از اسپانیا گزارش شده بودند را نشان داد.https://ijpp.areeo.ac.ir/article_697040_27ade3d2f27bd8ffabe6647405bc6f89.pdf